 | iqpnni.중요 사운넷 퍼즐 및 NNI 작동 |
| 지금 다운로드 | |
iqpnni. 순위 및 요약
광고
iqpnni. 태그
iqpnni. 설명
IQPNNI라는 이름은 중요한 사중주 수수께끼 및 NNI 작동을 의미합니다. 효율적인 나무 재구성 방법 (IQPNNI)은 DNA 또는 아미노산 서열 데이터에 기초한 계통 발생 나무를 재구성하기 위해 도입된다. 우리의 접근 방식은 다양한 빠른 알고리즘을 결합하여 잠재적 인 후보 나무 목록을 생성합니다. 핵심 성분은 N 시퀀스의 O (n ^ 2) 시간의 중간 트리의 계산을 허용하는 소위 중요한 사치 (IQ)의 정의입니다. 결과 트리는 가장 가까운 이웃 간지 (NNI) 작동을 적용하여 추가로 최적화됩니다. 이어서 시퀀스의 임의의 분획은 지금까지 발견 된 최고의 트리에서 삭제됩니다. 그런 다음 삭제 된 시퀀스는 중요한 사중주 수수께끼 (IQP) 알고리즘을 사용하여 작은 트리에 다시 삽입됩니다. 이러한 단계는 여러 번 반복되며 우도 기준에 관해서 가장 좋은 나무가 추론 된 계통 발생 나무로 간주됩니다. 또한 검색을 멈추는시기를 나타내는 규칙을 제안합니다. 주요 특징: 매개 변수가 풍부한 모델 에 대해 드문 경우에 실패한 모델 매개 변수 추정이 실패합니다. Invar + 감마율 이질성 GCC 4.3.2 와의 호환성 문제 Bionj Tree는 이제 초기 거리에서 두 번 재구성되고 수정 된 최대 가능성 거리
iqpnni. 관련 소프트웨어
