mrmodeltest.

C ÇÁ·Î±×·¥À» »ç¿ëÇÏ¿© DNA ´ëü ¸ðµ¨À» ¼±ÅÃÇϱâÀ§ÇÑ ÇÁ·Î±×·¥
Áö±Ý ´Ù¿î·Îµå

mrmodeltest. ¼øÀ§ ¹× ¿ä¾à

±¤°í

  • Rating:
  • ƯÇã:
  • GPL
  • °Ô½ÃÀÚ À̸§:
  • Johan Nylander
  • ¿î¿µÃ¼Á¦:
  • Windows All
  • ÆÄÀÏ Å©±â:
  • 461 KB

mrmodeltest. ű×


mrmodeltest. ¼³¸í

DNA EvolutionÀÇ ´Ù¸¥ ¸ðµ¨À» ºñ±³ÇÏ´Â °ÍÀº À¯¿ëÇÑ Á¤º¸¸¦ ÃßÃâÇÏ´Â µ¥ ÇÊ¿äÇÑ Áö½ÄÀ» °®´Â ƯÁ¤ »ç¿ëÀÚ ¼¼Æ®¸¦ À§ÇØ ¿¹¾à µÈ ÀÛ¾÷ÀÔ´Ï´Ù. ¶ÇÇÑ ¿î¿µÀ» ¼öÇàÇÏ´Â ±¸Ã¼ÀûÀÎ µµ±¸°¡ ÇÊ¿äÇϸç MrModeltest´Â ¸í·É ÇÁ·ÒÇÁÆ® Screenthe ÀÀ¿ë ÇÁ·Î±×·¥¿¡¼­ job.work ¿ëÀ¸·Î ¼³°èµÈ ÇϳªÀÇ À¯¿ë¼ºÀ» ¼³Ä¡ÇÒ ÇÊ¿ä°¡ ¾øÀ¸¸ç ÄÜ¼Ö ±â¹ÝÀÔ´Ï´Ù. ÀÌ´Â ÇÑ ¹ø ½ÇÇà µÇ´õ¶óµµ »ç¿ëÀÚ Áß ÀϺΰ¡ »ç¿ëÀÚ Áß ÀϺθ¦ ¸Ö¸® ÇÒ ¼ö ÀÖÁö¸¸ Áö¿øµÇ´Â ¸í·É°ú Àμö¿Í Àμö¸¦ »ç¿ëÇÏ´Â °Í¿¡ ´ëÇÑ ÀûÀýÇÑ ÁöħÀ» Á¦°øÇÕ´Ï´Ù. °³¹ßÀÚ´ÂÀÌ µµ±¸°¡ ƯÁ¤ µ¥ÀÌÅÍ¿¡ ´ëÇÑ Åë°è ¸ðµ¨ÀÇ »ó´ëÀûÀÎ Ç°ÁúÀ» ÃøÁ¤ÇÏ´Â ¿ìµµ ºñÀ² Å×½ºÆ® ¹× AIC (AKAIKE Á¤º¸ ±âÁØ)¸¦ »ç¿ëÇÑ´Ù´Â °ÍÀ» ¾Ë·ÁÁÝ´Ï´Ù. °³¹ßÀÚ°¡ Á¦°ø ÇÑ Ãß°¡ ¼¼ºÎ »çÇ×Àº 24·Î ¼³Á¤µÈ ÀÀ¿ë ÇÁ·Î±×·¥ÀÌ Áö¿øÇÏ´Â ´ºÅ¬·¹¿ÀŸÀÌµå ´ëü ¸ðµ¨ÀÇ ¾çÀ» ÁöĪÇϸç, ¸ðµç °ÍÀÌ MRBayes °ø±¸ (BayesianÀÇ Bayesian ÃßÁ¤¿¡ »ç¿ëµÊ)¿¡¼­ ÁöÁ¤ÇÒ ¼ö ÀÖ½À´Ï´Ù. Áö¿øµÇ´Â CommandSDespite ¸ñ·ÏÀº Console âÀÌ Áö¿øµÇ´Â ¸í·É ¸ñ·ÏÀ» º¸¿© ÁֹǷΠConsole âÀÌ Ç¥½ÃµÇ¹Ç·Î MrModelTest¸¦ »ç¿ëÇÏ´Â ±×·¡ÇÈ »ç¿ëÀÚ ÀÎÅÍÆäÀ̽º°¡ ³Ê¹« ¾î·Á¿ï ¼ö ÀÖ½À´Ï´Ù. ÀÌ ÇÁ·Î±×·¥Àº HLRT2 / 3 / 4 °èÃþÀ» ¼±ÅÃÇÏ°í ¾ËÆÄ ¹× µð¹ö±× ·¹º§À» Á¤ÀÇ ÇÒ ¼ö ÀÖ½À´Ï´Ù. ÀÏÀ» ´õ ½±°ÔÇϱâ À§ÇØ È­¸é¿¡ ¿¹Á¦°¡ Ç¥½ÃµË´Ï´Ù. ¶ÇÇÑ AIC ¶Ç´Â LRT °è»ê±â ¸ðµå¸¦ È°¼ºÈ­ÇÏ°í ºÐ·ù ¼ö¸¦ ¼³Á¤ÇÒ ¼ö ÀÖ½À´Ï´Ù. ´ëºÎºÐÀÇ ÀÛ¾÷¿¡´Â »ç¿ëÀÚ°¡ µµ¿òÀÌ µÉ ¼öÀÖ´Â Ãß°¡ ÅøÆÁÀÌ ÀÖ½À´Ï´Ù. ºñ±³ DNA Evolution ModelsmrModeltest´Â ´ºÅ¬·¹¿ÀŸÀÌµå ´ëü ¸ðµ¨ÀÇ °ÅÀÇ µÎ ¹è¸¦ Áö¿øÇÏ´Â ModelTest ÀÀ¿ë ÇÁ·Î±×·¥ÀÇ Æ÷Å©ÀÔ´Ï´Ù. ±×·¯³ª ±× ÀÌÁ¡Àº À̵éÀÌ À̵éÀÌ °èÅë ¹ß»ý ÃßÁ¤À»À§ÇÑ MRBayes À¯Æ¿¸®Æ¼¿¡¼­ ±¸Çö µÉ ¼ö ÀÖ´Ù´Â °ÍÀÔ´Ï´Ù. Ionut Ilascu°¡ °ËÅä ÇÑ, 2014 ³â 6 ¿ù 2 ÀÏ ¸¶Áö¸· ¾÷µ¥ÀÌÆ®


mrmodeltest. °ü·Ã ¼ÒÇÁÆ®¿þ¾î

rnashapes.

ÃàÀû µÈ ¸ð¾ç È®·üÀÇ °è»ê ¼Óµµ¸¦ ³ôÀ̱âÀ§ÇÑ ·±Å¸ÀÓ ÈÞ¸®½ºÆ½ ...

193 1.2 MB

´Ù¿î·Îµå