 | 밀도조사를 돕는 도구 |
| 지금 다운로드 | |
밀도 순위 및 요약
광고
밀도 태그
밀도 설명
전자 현미경은 구조 생물학에서 중요한 도구가되었습니다. 그럼에도 불구하고, 그럼에도 불구하고, 그럼에도 불구하고, 단일 분자 또는 2D 결정의 형태로 전자 현미경으로 연구 될 수있는 3D 결정에 의해 결정될 수없는 많은 단백질. 그러나 결과 구조물에는 훨씬 낮은 해상도가 있습니다. 드문 예외를 사용하면 전자 현미경으로 얻은 전자 밀도 맵은 원자 해상도에서 구조를 확인하기에 충분하지 않습니다. 일부 상황에서는 다른 형태로 동일한 단백질의 원자 수준 구조를 사용할 수 있습니다. DenessFit 은이 정보를 저해상도 구조로 결합하도록 설계된 도구입니다. 이 파이썬 기반 공구는 알려진 원자 구조를 변형시켜 저해상도 전자 밀도 맵에 적합하게 만듭니다. 단백질의 유연성은 저에너지 정상 모드가 허용되는 변형을 정의하는 탄성 네트워크 모델에 의해 기술된다. 이 절차는 단백질의 무결성이 변형 중에 보존된다는 것을 보장합니다. 공개 된 다른 유사한 알고리즘과 비교하여, 밀도 변환에 구현 된 것은 중형 단백질, Ca-Atpase에 대한 실제 실험 데이터에 대해 테스트 된 장점이있다. 알고리즘과 Ca-Atpase에 대한 응용 프로그램은
밀도 관련 소프트웨어
