 | oligocheck.계통 발생 프로브 및 프라이머 세트의 품질 확인 |
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oligocheck. 설명
OLIGOCHECK은 잠재적 인 목표 서열이 증가함에 따라 프라이머 세트 또는 프로브의 계통 발생 범위를 평가함으로써 견고성을 평가하여 견고성을 평가하기 위해 설계된 Java 기반 도구입니다. 사용자는 핵산 시퀀스의 데이터베이스와 함께 프라이머 세트 또는 프로브를 확인하기 위해 탐침을 제공합니다. OLIGOCHECK는 Primer 세트 또는 데이터베이스의 각 관련 레코드에 대해 프로브를 확인하고 허용되는 기본 불일치 수가 증가하면 일치하는 일치 여부를 메모합니다. 결과 분석은 시퀀스 레코드 데이터와 함께 그래픽 형식으로 표시됩니다. 핵산 프라이머 세트 및 정확한 핵산 서열에 독점적으로 결합하는 프로브의 능력은 특정 계통 발생기의 정확한 표적화에 대한 근본적이다. 이러한 특이성은 이러한 올리고 뉴클레오티드 표적 이들 핵산 서열의 영역의 고유성에 크게 의존한다. 영역이 더 독특할수록 어닐링 온도 및 기타 생화학 적으로 관련된 파라미터의 변화가 하나 이상의 기본 차이가있는 표적과 성공적으로 성공적으로 성공적으로 구속되는 올리고 뉴클레오타이드가 발생하더라도, 의도 된 목표물에만 프라이머 세트 또는 프로브가 원하는 대상으로 만 어닐링 될 것입니다. 따라서, 견고한 프라이머 세트 또는 프로브는 하나 이상의 불일치가 허용되는 경우에도 의도 된 목표에 대해 독점적으로 어닐링되는 것을 볼 수 있습니다.
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