 | pknotsrg.RNA 폴딩 및 열역학적 일치 |
| 지금 다운로드 | |
pknotsrg. 순위 및 요약
광고
- 특허:
- Freeware
- 가격:
- FREE
- 게시자 이름:
- pknotsRG Team
- 게시자 웹사이트:
- http://bibiserv.techfak.uni-bielefeld.de/pknotsrg/
- 운영체제:
- Mac OS X
- 파일 크기:
- 359 KB
pknotsrg. 태그
pknotsrg. 설명
RNA 접이식 및 열역학적 일치 PKNOTSRG는 간단한 재귀 적순환의 클래스를 포함하여 RNA 2 차 구조를 접을 수있는 커맨드 라인 기반 도구입니다. 의사가없는 구조물에 대한 에너지 파라미터는 실제 MFORD 3.1과 동일합니다. 의사의 에너지는 pknots에서 리브화물이 사용하는 것과 유사한 모델로 계산됩니다. 접이식 온도는 37C에 고정되어 있습니다. · PKNOTSRG-MFE : 최소한의 자유 에너지의 S (매듭이 든다)의 구조를 계산합니다. · PKNOTSRG-ENF : Pseudoknot 시행 : 그것은 에너지로 · PKNOTSRG-LOC : 뉴클레오타이드 당 자유 에너지로 "가장 좋음"이 정의되는 S의 모든 구조의 요소 일 수있는 최상의 로컬 의사 노트를 제공합니다. 나머지는 남아 있습니다. 이 릴리스에서는 새로운 기능 : · 가비지 수집 라이브러리가 더 이상 필요하지 않습니다 · 대화 형 모드 · FASTA 파일 입력을 지원합니다 · 새 옵션 -w : 슬라이딩 윈도우 · 새 옵션 -s : 구조용 출력 너비
pknotsrg. 관련 소프트웨어
