생물학자 무료 생물 정보학 파이썬 응용 프로그램 및 라이브러리 패키지
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무료 생물 정보학 파이썬 응용 프로그램 및 라이브러리 패키지 Biopython은 BioInformatics에서 현재 및 미래의 작업의 요구를 해결하는 무료 파이썬 애플리케이션 및 라이브러리를 개발하기위한 분산 공동 노력입니다 .Biopython은 컴퓨터에서 일하는 생물 학자들에게 관심있는 "사물"을 다루는 능력을 제공하는 능력을 제공하는 도서관 세트입니다. 일반적으로 이것은 적어도 일부 프로그래밍 경험 (Python에서, 물론!) 또는 최소한 프로그램 학습에 대한 관심이 있어야합니다. Biopython의 직업은 특정 파일 형식을 구문 분석하는 인테리어에 초점을 맞추는 대신 특정 파일 형식 (물론, 도움이되면 존재하지 않는 파서를 작성하고 생물학적으로 그것을 기여하십시오!).). 바이오피드의 일은 당신을 행복하게 만드는 것입니다! 다음은 "Biopython"의 주요 기능이 있습니다. · 생물 정보학 파일을 Python 활용도 데이터 구조로 구문 분석하는 기능 · 지원되는 형식의 파일은 레코드 또는 인덱싱 및 사전 인터페이스를 통해 액세스하여 레코드를 반복 할 수 있습니다. · 인기있는 온라인 생물 정보학 목적지를 다루는 코드 · 공통 생물 정보학 프로그램에 대한 인터페이스 · 시퀀스, 시퀀스의 ID 및 시퀀스 기능을 다루는 표준 시퀀스 클래스. · 번역, 전사 및 체중 계산과 같은 서열에 대한 공통 연산을 수행하는 도구. k k 가장 가까운 이웃, 순진한 베이 또는 지원 벡터 기계를 사용하여 데이터의 분류를 수행하는 코드. · 대체 매트릭스를 만들고 다루는 표준 방법을 포함하여 정렬을 다루는 코드. · 코드를 별도의 프로세스로 분리 할 수있는 코드를 쉽게 분리 할 수 있습니다. · 기본 시퀀스 조작, 번역, 발파 등을 수행하는 GUI 기반 프로그램 ·이 파일, 온라인 Wiki 문서, 웹 사이트 및 메일 링리스트를 포함하여 모듈 사용에 대한 광범위한 문서 및 도움말. · BioPerl 및 Biojava 프로젝트가 지원하는 시퀀스 데이터베이스 스키마 인 BiosQL과의 통합. 요구 사항 : · 파이썬 2.3 이상 · NUMPY. 이 릴리스에서는 새로운 기능 : · 인구 유전학 모듈에서의 Tiago Antao의 작업은 F-Statistics, Null 대립 유전자 주파수 및 이동 속도의 추정 및 거리 (IBD) 및 Hardy Weinberg 평형의 편차뿐만 아니라 F-Statistics, Null 대립 유전자 주파수 및 이동 속도의 추정을 허용하는 제네니아를위한 명령 줄 래퍼를 제공합니다. · Bio.Seqio 및 Bio.Alignio는 모두 이제 파일 형식 간의 간단한 (잠재적으로 최적화 된) 변환을 허용하는 새로운 Convert () 기능을 갖추고 있습니다. Bio.Seqio는 해당 파일의 모든 레코드를 메모리로 읽지 않고 파일의 순서에 대한 임의 액세스를 허용하는 새로운 색인 () 함수를 가져옵니다. · 새로운 릴리스는 또한 Phylip Phylogeny 프로그램의 엠 보스 버전 및 Novacraft의 Novoalign 어셈블러에 대한 명령 줄 래퍼를 추가합니다. 1.51 이후로보고 된 몇 가지 사소한 버그가 발표되었습니다.

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