Mspire. 루비의 질량 분석기 단백질을위한 무료 및 오픈 소스 도구
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전환하다 분석 파서 MZDATA 파서 Apex Parser. Obiwarp 변환기

Mspire. 설명

루비의 질량 분광법 단백질을위한 무료 및 오픈 소스 도구 MSPIRE (Ruby의 질량 분광기 Proteomics)는 Ruby에서 MS Proteomics 데이터로 작업하는 도구 모음입니다. Mspire는 개방형 표준 (예 : MZData, 펩타이드 / 단백질 / 단백질 / 단백질 선지자 및 TPP)에 대한 지원을 제공하고 루비에서 질량 분광법 데이터 작업을위한 다른 유용한 기능을 제공하고 있습니다. 데이터 (특히 Bioworks 3.2-3.3) · MZXML · MZDATA · ProteinProphet · ObiWarpValidation 용 파일 준비 · 다양한 Decoy 데이터베이스 검색 옵션 : 다양한 해시 옵션 (예 : 아미노산에 의한) 서열 + 충전 · 아미노산 (예 : 차단되지 않은 시스테인 검색) · Transmembrane 예측 (코오 멤브레인 예측) · 일반 샘플 바이어스 (예 : 낮은 풍부 / 높은 풍요 로움) · 정의 된 샘플은 여기에 "mspire"의 주요 기능이 있습니다. · MZXML (버전 1, 2 및 3) 구문 분석 · MZDATA 구문 분석 · Bioworks .srf (바이너리 파일) 리더기 · 읽기 / 쓰기 .sqt 파일 · 펩티드 프로판 입력 (PepxML 파일)에 대한 바이오 디스크 · 경량 Apex 값 파서 · 히스토그램 단백질 확률 · 사용자 정의 거짓 ID 컷오프 값을 사용한 단백질 요약보기 · OBI-Warp 입력 파일로 변환 · 휴대용 : 플랫폼에서 작동합니다 이 릴리스에서는 새로운 기능 : · DECOY_TO_TARGET_RATIO 대신 PI_ZERO를 사용합니다. 모든 테스트가 통과하는 동안이 릴리스는 목표 - 데코이 유효성 검사를 사용하여 실험적으로 간주되어야합니다.

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