Bio :: Nexus :: DistanceBlock.

BIO :: NEXUS :: DISTALISSBLOCK은 NEXUS 파일의 거리 블록을 나타내는 PERL 모듈입니다.
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Bio :: Nexus :: DistanceBlock. 순위 및 요약

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  • Tom Hladish
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  • http://search.cpan.org/~tjhladish/Bio-NEXUS-0.67/lib/Bio/NEXUS/DistancesBlock.pm

Bio :: Nexus :: DistanceBlock. 태그


Bio :: Nexus :: DistanceBlock. 설명

Bio :: Nexus :: DistancesBlock은 Nexus 파일의 거리 블록을 나타내는 Perl 모듈입니다. Bio :: Nexus :: DistancesBlock은 Nexus 파일의 거리 블록을 나타내는 Perl 모듈입니다. DistanceBlock 클래스는 넥서스 거리 블록을 나타내며이 블록 내의 데이터를 읽고 쓰고 및 액세스하는 방법을 제공합니다. 거리 매트릭스 (거리)는 거리 매트릭스를 포함하거나 각각의 가능한 한 쌍의 Taxa.methodsnew 타이틀 사이의 계산 된 거리 테이블 : 새로운 사용법 : block_object = new bio :: nexus :: DistanceBlock ($ block_type, $ 명령, $ verbose, $ taxa); 기능 : 새 BIO :: Nexus :: DistanceBlock 개체 반환 값 : BIO :: Nexus :: DistanceBlock Object args : 유형 (문자열), 구문 분석 (배열 참조) 및 자세한 플래그 (0 또는 1) get_matrix 제목 : get_matrix 사용법 : $ matrix = $ self-> get_matrix (); 함수 : 전체 거리 매트릭스 리턴을 검색합니다. 해시 reRefs args의 해시 args : 없음 참고 : 행 및 열 키를 지정하여 거리 값을 검색 할 수 있습니다. $ dist = $ matrix -> {$ row_taxon} {$ col_taxon} get_distances_for title : get_distances_for 사용법 : % baxon1_distances = % {$ self-> get_distances_for ($ first_taxon)}; 함수 : 거리 매트릭스의 행을 검색합니다. args : 행의 행 레이블 (문자열) get_distance_between title : get_distance_between 사용법 : $ distance = $ self-> get_distance_between ($ row_taxon, $ column_taxon); 함수 : 매트릭스 반환 값에서 셀을 검색합니다. a 스칼라 (number) args : 셀의 행 및 열 레이블 (두 taxa) 원하는 참고 : 일반적으로 get_distance_between ($ b) == get_distance_between ($ b, $ a ); 그러나 거리 매트릭스가 대칭이 아니면 이는 사실이 아닐 필요가 없습니다. 원하는 거리를 요구하고 있는지 확인하십시오. 요구 사항 : · Perl.


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