¹ÙÀÌ¿À :: Nexus :: UnlignedBlock.

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  • Rating:
  • ƯÇã:
  • Perl Artistic License
  • °¡°Ý:
  • FREE
  • °Ô½ÃÀÚ À̸§:
  • Thomas Hladish
  • °Ô½ÃÀÚ À¥»çÀÌÆ®:
  • http://search.cpan.org/~tjhladish/Bio-NEXUS-0.67/lib/Bio/NEXUS/CodonsBlock.pm

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BIO :: NEXUS :: UnlignedBlockÀº Nexus ÆÄÀÏÀÇ Á¤·ÄµÇÁö ¾ÊÀº ºí·ÏÀ» ³ªÅ¸³»´Â Perl ¸ðµâÀÔ´Ï´Ù. BIO :: NEXUS :: UNALignedBlockÀº nexus file.synopsisÀÇ Á¤·ÄµÇÁö ¾ÊÀº ºí·ÏÀ» ³ªÅ¸³»´Â Perl ¸ðµâÀÔ´Ï´Ù. ($ type = ~ / Á¤·ÄµÇÁö ¾ÊÀº / i) {$ block_object = new bio :: nexus :: UnalignedBlock ($ type, $) ºí·Ï, $ verbose); } ÀÌ´Â Nexus FileMethodsNew Á¦¸ñÀÇ Á¤·ÄµÇÁö ¾ÊÀº ºí·ÏÀ» ³ªÅ¸³»´Â Ŭ·¡½ºÀÔ´Ï´Ù. »õ »ç¿ë¹ý : block_object = new bio :: nexus :: UnlignedBlock ($ block_type, $ ¸í·É, $ verbose, $ taxlabels); ±â´É : »õ BIO :: NEXUS :: UNALIGNEDBLOCK °³Ã¼ ¹Ýȯ °ª : BIO :: NEXUS :: UNALignedBlock Object args : Çü½Ä (¹®ÀÚ¿­), ±¸¹® ºÐ¼® (¹è¿­ ÂüÁ¶) ¹× ÀÚ¼¼ÇÑ Ç÷¡±× (0 ¶Ç´Â 1) find_taxon Á¦¸ñ : find_taxon »ç¿ë¹ý : My $ is_taxon_present = $ self-> find_taxon ($ taxon_name); ±â´É : ÀÔ·Â ºÐ·ùÀÚ À̸§ÀÌ ºÐ·ùÀÚ ¶óº§¿¡ ÀÖ´ÂÁö ¿©ºÎ¸¦ ã½À´Ï´Ù. ¹Ýȯ °ª : 0 (¾øÀ½) ¶Ç´Â 1 (ÀÖ´Â °æ¿ì). args : ºÐ´ç ·¹À̺í (¹®ÀÚ¿­·Î) set_format Á¦¸ñ : set_format »ç¿ë¹ý : $ block-> set_format (% Çü½Ä); ÇÔ¼ö : ¹®ÀÚÀÇ Çü½ÄÀ» ¼³Á¤ÇÕ´Ï´Ù. ¾øÀ½ args : format valuesGet_Format Á¦¸ñ Çؽà : get_format »ç¿ë¹ý : $ block-> get_format (); ±â´É : ¹®ÀÚÀÇ Çü½ÄÀ» ¸®ÅÏÇÕ´Ï´Ù. Çü½Ä °ªÀÇ Çؽà args : noneset_otuset Á¦¸ñ : set_otuset »ç¿ë¹ý : $ block-> set_otuset ($ OTUSET); ±â´É : OTUS ¸®ÅÏÀ» ¼³Á¤ÇÕ´Ï´Ù. ¾øÀ½ args : none args : taxunitset objectset_charstatelabels Á¦¸ñ : set_charstatelabels »ç¿ë¹ý : $ block-> set_charstatelabels ($ labels); ÇÔ¼ö : ¹®ÀÚ À̸§°ú »óŸ¦ ¼³Á¤ÇÕ´Ï´Ù. ¾øÀ½ args : ¹®ÀÚ STACKET_CHARSTATELabelsÀÇ ¹è¿­ Á¦¸ñ : get_charstatelabels »ç¿ë¹ý : $ set-> get_charstatelabels (); ±â´É : ¹®ÀÚ »óÅ ¹è¿­À» ¹ÝȯÇÕ´Ï´Ù. ¹®ÀÚ »óÅ args : noneget_ntax Á¦¸ñ : get_ntax »ç¿ë : $ block-> get_ntax (); ÇÔ¼ö : ºí·ÏÀÇ ºÐ·ù ¹øÈ£ ¼ö¸¦ ¹ÝȯÇÕ´Ï´Ù. # taxa args : nonerename_otus title : rename_otus »ç¿ë¹ý : $ block-> rename_otus (% ¹ø¿ª %); ±â´É : ¸ðµç OTUÀÇ À̸§À» ´Ù¸¥ ¹ÝȯÀ¸·Î ¹Ù²ß´Ï´Ù. ¾øÀ½ args : Çؽø¦ Æ÷ÇÔÇÑ Çؽà À̸§ : equals »ç¿ë¹ý : $ block-> equals ($ ´Ù¸¥ $); ±â´É : µÎ °³ÀÇ ¹ÙÀÌ¿À :: nexus :: unlignedblock °´Ã¼°¡ µ¿ÀÏÇÑ ¹Ýȯ °ªÀÌÀÖ´Â °æ¿ì : boolean args : a bio :: nexus :: characterBlock °´Ã¼ ¿ä±¸ »çÇ× : ¡¤ Perl.


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