 | pypedal.이 응용 프로그램으로 Pedigrees 조작 |
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Pypedal은 Pedigrees의 조작을위한 악기를 제공하기로되어있는 파이썬 모듈로 설계되었습니다. 제공된 도구는 또한 Pedigrees의 간단한 시각화와 Pedigrees의 유전 적 다양성의 조치 계산을 제공 할 수도 있습니다. 주요 특징: 사용자 정의 형식의 혈통 파일 읽기 혈통 무결성 (중복 된 ID, 부모보다 젊은 부모 등) 혈통 파일의 외관 빈도와 같은 요약 정보 생성 혈통 파일의 재정렬 및 번호 취소 표 형식 메소드 를 사용하여 혈통 파일에서 분자 관계 행렬 (a) 계산 대형 Pedigrees 에 대한 민수 계산 평균 총계 및 평균 개별 개별 계수의 교배 및 관계 반복적 인 표 형태의 방법을 이용한 부분적으로 섭취되는 부분의 계수 계산 (LACY, 1996; Gulisija, 2006) Ballou (1997) 또는 Suwanlee et al. (2007) 이론적 및 실제 효과적인 인구 크기의 계산 레이스 의 정확한 알고리즘을 사용하여 효과적인 창시자 번호의 계산 Boichard et al. 의 대략적인 알고리즘을 사용하여 효과적인 창시자 번호의 계산 Boichard et al. 알고리즘을 사용하여 효과적인 조상 번호의 계산 동물의 모든 조상을 포함하는 subpedrigrees의 선택 두 동물의 공통 친척들의 식별 잠재적 인 짝짓기 로부터 자손의 자손을 섭취하는 계산 Matrices, Inbreeding 및 관계 계수 및 요약 정보 를 포함하여 ASCII 텍스트 파일로 출력 출력 GEDCOM 5.5 파일의 수입 및 수출 유전자 수입 및 수출 1.20 (dBase III) 파일 PEDIGREES를로드하고, MySQL, Postgres 및 SQLite 데이터베이스로 저장 MATVEC 1.1A 에서 파생 된 알고리즘을 사용하여 생물체의 시뮬레이션
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