 | pknotsrg.RNA 폴딩 및 열역학적 일치 유틸리티. |
| 지금 다운로드 | |
pknotsrg. 순위 및 요약
광고
pknotsrg. 태그
pknotsrg. 설명
PKNOTSRG는 간단한 재귀적인 의사 구제를 포함하여 RNA 2 차 구조를 접는 공구입니다. 프로그램은 O (n ^ 4) 시간 및 o (n ^ 2) 공간에서 실행되므로 Bibiserv에 대한 응용 프로그램은 최대 800 염기의 서열로 제한됩니다. 의사가없는 구조물에 대한 에너지 매개 변수는 실제 MFORD 3.1과 동일합니다. 접이식 온도는 37 ℃로 고정됩니다. 현재 사용할 수있는 세 가지 모드가 있습니다. PKNOTSRG-MFE : 최소한의 자유 에너지의 S (매듭이 든다)의 구조를 계산합니다. PKNOTSRG-ENF : Pseudoknot 강제 : 어딘가에 적어도 하나의 의사 노트가 포함 된 S에 정력적으로 가장 완벽한 구조를 제공합니다. PKNOTSRG-LOC : 뉴클레오타이드 당 자유 에너지로 "가장 좋음"이 정의되는 S의 모든 구조의 요소가 될 수있는 최상의 로컬 의사 노트를 제공합니다. 나머지는 남아 있습니다 pknotsrg를 얻고 스핀을 가져 가서 실제로 당신을 위해 할 수있는 것을 볼 수 있습니다!
pknotsrg. 관련 소프트웨어
