ontomine. Ontomine은 생체 활성, 독성 및 부작용 예측을위한 자동 분자 광산에 사용되는 데이터 마이닝 소프트웨어입니다. 온톨인은 약 100.0의 실험적으로 결정된 속성을 기반으로합니다.
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ontomine. 설명

생체 활성을위한 자동 분자 광산에 사용되는 데이터 마이닝 소프트웨어 Ontomine은 생물 활성, 독성 및 부작용 예측을위한 자동 분자 광산에 사용되는 데이터 마이닝 소프트웨어입니다. Ontomine은 데이터베이스, 백과 사전 및 기타 문헌에서 수집 된 100.000 개의 다양한 소형 분자의 실험적으로 결정된 특성을 기반으로합니다. 이 데이터 세트는 수천 개의 수천 개의 생물 활성도, 약물 표적, 치료 학적 영역, 부작용 및 독성으로 구성된 계층 적 나무로 구성됩니다. 각 클래스는 측쇄 / 화학적 활성, 링 구조 등의 존재 / 부재 / 카운트와 같은 분자 특성을위한 관련 분자의 지문으로 표현됩니다. 다른 기존 방법과의 온톨인과 비교 현재 사용되는 생체 활성 예측 접근법은 세 가지 범주로 분류 될 수 있습니다. * 그래프 이론적 및 하부 구조, 토폴로지 및 물리 화학 기술자 * 최대 일반 하부 구조, 지문 유사점 및 기계 학습 방법 * 원자 이웃 방법 그러나 이러한 방법은 현재 거리 메트릭 의존성과 같은 요인에 의해 제한적이며, 활동을 대표하지 않고 몇 가지 다른 수준에서 QSAR 모델을 구축하기가 어렵고, 예를 들어, 약물 표적, 바이오 공정 및 치료 면적뿐만 아니라 결과의 해석. 온토마인 (미국 특허)은 이러한 방법에 대한 구조 정보를 화학적, 생물학적으로 또는 약리학 적으로 관련 분자에 대한 구조 정보를 개념 및 디스크립터의 계층 적 스키마에 변형시킨다. Ontomine은 관련 스키마의 패턴을 발견하고 패턴을 분석하는 것으로 추진 된 규칙을 사용하여 생물학적 활동을 예측합니다. Ontomine 알고리즘의 하나의 중요한 이점은 활동이 발견 될 때 코어 스캐 폴드가 보존되지 않기 때문에 비계가 호핑을 가능하게한다는 것입니다. Ontomine 패턴은 비계와 관계없이 생물 활성을위한 "필요하지만 충분하지 않은"조건을 나타냅니다. 명시적인 스캐 폴드 호핑은 헌법 적 이성질체를 생성하고 룰베이스를 사용하여 흥미로운 분자를 선택하여 수행 할 수 있습니다. 온톨인의 결과는 활동을 나타내는 간단한 이해할 수있는 패턴으로 표시됩니다. 또한 온토마인 예측은 수백만 분자로 확장 성이 가능합니다. 또한, 큐레이 한 온톨인 데이터 세트는 사내 복합 컬렉션의 측정 분자 활동의 내부 데이터 세트가 추가 될 수 있습니다.

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