 | mmass.단백질 서열 처리 및 질량 스펙트럼 해석을위한 여러 모듈 및 도구 |
| 지금 다운로드 | |
mmass. 순위 및 요약
광고
mmass. 태그
mmass. 설명
프로그램 MMASS는 대량 분광 측정 데이터 분석을위한 간단한 도구의 오픈 소스 다중 플랫폼 패키지를 제공합니다. MMASS 응용 프로그램은 일반적인 프로테오믹스 작업에 초점을 맞춘 단백질 시퀀스 핸들링 및 질량 스펙트럼 해석을위한 여러 모듈 및 도구로 구성됩니다. 주요 특징: 다중 형식 지원 : MMASS는 MZDATA 및 MZXML과 같은 여러 질량 분광 형식을 지원합니다. 질량 스펙트럼 또는 Paklist 데이터는 탭, 공간, 쉼표 또는 세미콜론으로 구분 된 두 개의 열 (M / Z 값 및 강도 값)으로 구성된 간단한 ASCII 파일에서 쉽게 가져올 수 있습니다. 또한 Bruker Daltonic Flex Series Instruments의 기본 데이터에 대한 지원이 있습니다. MMASS의 널리 사용되는 기능 중 하나는 빈 문서를 열고 수동으로 paklist를 만드는 기능입니다. 이 기능은 특히 라벨이있는 피크의 스펙트럼 이미지 또는 인쇄 목록 만 사용할 수있는 경우에만 특히 유용합니다. 데이터 처리 : 마지막으로, 자동 피크 피킹, 탈성소, 기준 보정 및 평활화와 같은 처리 기능이 있습니다. 보정 : 데이터 재 보정에는 두 가지 방법을 사용할 수 있습니다. 내부 보정은 내부 참조 값을 사용하여 고전적인 교정 방법입니다. 내부 참조 값의 광범위한 목록을 사용할 수 있으며 새로운 값을 쉽게 추가 할 수 있습니다. 셀프 교정이라고하는 통계 교정은 펩타이드 질량 스펙트럼을위한 특별한 방법입니다. 두 가지 방법 모두에게는 선형 또는 2 차 피팅을 사용할 수 있습니다. 시퀀스 도구 : MMASS는 다른 모듈에 이용 가능한 단백질 또는 펩타이드 서열을 만드는 데 사용할 수있는 내부 서열 편집기를 제공합니다. 모든 수정은 고정 또는 변수로 적용될 수 있습니다. 단백질 다이제스트 도구는 특정 단백질 서열의 실리코 효소 또는 화학적 소화로 인한 펩타이드 목록을 생성하는 데 사용할 수 있습니다. 유사하게, 펩타이드 단편화 공구는 일반적인 펩타이드 단편의리스트를 생성한다. 두 경우 모두 변수 수정의 모든 조합이 계산되고 결과는 측정 된 데이터와 쉽게 비교할 수 있습니다. 또한, 비특이적 절단 등을 식별하기 위해 서열 검색 도구에 의해 특정 펩타이드 질량을 검색 할 수있다. 질량 계산기 : 질량 계산기 도구는 주어진 공식의 동위 원소 패턴을 시뮬레이션하는 데 사용할 수 있으며 생성 된 프로파일 스펙트럼은 실제 데이터와 쉽게 비교할 수 있습니다. 복합 검색 : 복합 검색 도구를 사용하여 스펙트럼에서 모든 사용자 지정 화합물을 검색 할 수 있습니다. 모든 화합물은 분자식으로 지정되므로 모노 이소 원통 또는 평균 질량 모두 모두 충전으로 검색 할 수 있습니다. 또한 일부 부가 물을 검색 할 수 있습니다. 피크 차이 : 질량 스펙트럼의 해석은 전형적으로 스펙트럼의 모든 봉우리 간의 차이점을 착용하지 않는 검사를 포함한다. 그러나 최대 차이점 도구는 kedlist의 피크 사이의 모든 차이점을 간단히 생성 할 수 있습니다. 이 표는 모든 아미노산, 계산 된 디 펩티드 또는 특정 질량 값의 각 질량과 각 질량과 각 차이를 자동으로 비교하는 데 자동으로 비교하는 데 사용할 수 있습니다. 마스코트 검색 : 질량 분석법은 단백질 식별을위한 매우 인기있는 도구이지만, 공개적으로 온라인으로 사용할 수 없을 수는 없을 것입니다. MMASS는 마스코트 웹 사이트에서 사용할 수있는 세 가지 주요 도구로 데이터를 직접 전송할 수있는 인터페이스를 제공합니다. 펩타이드 대량 지문, 시퀀스 쿼리 및 MS / MS 이온 검색.
mmass. 관련 소프트웨어
