WPDB 데이터베이스 로더 생물학적 거대 분자의 3D 구조를 빠르고 쉽게 분석합니다.
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WPDB 데이터베이스 로더 순위 및 요약

WPDB 데이터베이스 로더 태그

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WPDB 데이터베이스 로더 설명

WPDB 데이터베이스 로더는 위에 표시된 것과 같은 쿼리 및 디스플레이 도구를 사용하여 단백질 데이터 뱅크 (PDB)에서 발견되는 생물학적 거대 분자의 3 차원 구조를 조사 할 수 있도록 특별히 고안된 쉽고 사용하기 쉽습니다. 주요 특징: 과학 : 텍스트 및 시퀀스를 기반으로 구조를 찾습니다. 검색 (허용되지 않음). 니즈치 및 Wunsch (JMB 48 (3) : 443-453, 1970)의 방법에 따른 다수의 목표 서열에 대한 하나의 레지스터 시퀀스의 서열 배향. 헨드 릭슨 (Acta Crysta35 : 158-163, 1979. Kabsch와 Sander의 방법에 따라 2 차 구조 할당. 아미노산 속성 프로파일 분석, 정적 및 동적 : Bogardt et al;에 의해 컴파일 된 값에 따라 정적; Lee 및 Richards (JMB 55 : 379-400, 1971)에 따른 동적 인 평균 노출 및 2 개의 정렬 된 폴리 펩타이드 사슬에 대한 단일 폴리펩티드 사슬 또는 차이 프로파일에 대한 실험 B FactorProfiles가 검사 될 수 있습니다. 다른 컷 - 오프 거리에서 접촉 맵 분석과, 콘티틀 구조물의 다른 원자 그룹 또는 중첩 된 구조 (차이점 맵)를 검사 할 수 있습니다. 표준 3 차원보기 및 렌더링, 하부 구조, CPK 표현, 스테레오 및 간단한 표면을 표시하거나 강조 표시 (사용자로부터의 거리를 기준으로 컬러)를 표시합니다. 지오메트리 계산 (본드 길이, 결합 각도, 이위 각도, 근접 각도, 근접 비 접촉 접촉)은 그래픽 표현 및 작은 분자 거리에서의 편차를 포함합니다. 컴퓨팅 : 데이터 압축 - PDB ASCII 파일 배포를 통한 스토리지의 20 배 감소, (i) 저자 및 JRNL 레코드로 제한된 서지 정보; (ii) 선택적으로 NMR 또는 모델 구조의 앙상블의 첫 번째 또는 모든 구성원; (iii) 부분 점유기가있는 결정 구조물의 일부에 대해 PDB 파일에 정의 된 바와 같은 첫 번째 대안 적립만을 포함한다. (iv) 원자 좌표는 3 개의 소수 자리가 아니라 2로 반올림 된 원자 좌표; (v) PDB 비고 기록 없음. 상호 운용 가능한 디스플레이 객체 - 하나의 디스플레이 객체 (E.GA 연락처 맵)에서 기능을 선택하면 다른 모든 표시 객체 (E.G3-D 뷰어) 및 이후 호출 된 모든 다른 표시 객체도 업데이트되어이 기능을 설명하기 위해 업데이트됩니다. . 인기있는 분자 디스플레이 프로그램을 raswin에 직접 접근합니다. DoctoHelp 패키지를 사용하여 생성 된 인쇄 된 문서 및 상황에 맞는 도움말을 동기화했습니다.

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