Tagsorter. Tagsorter는 Sage 태그 시퀀스의 정렬, 정렬, 비교 및 식별을 단순화하기 위해 빌드 된 데이터베이스 프로그램입니다.
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Tagsorter. 순위 및 요약

Tagsorter. 태그

꼬리표 데이터 베이스 데이터베이스 관리자 다소 현자 확장자 대조

Tagsorter. 설명

Tagsorter는 Sage 태그 시퀀스의 데이터 정렬, 정렬, 비교 및 식별을 단순화하기 위해 빌드 된 데이터베이스 프로그램입니다. 유전자 발현 (SAGE)의 연속 분석은 유전자 발현 프로파일을 측정하기위한 높은 PUT 기술 (Velculescu et al, 1995)이다. 그것은 표현 된 성적 증명서와 그들의 상대적인 풍요의 정체성을 모두 드러냅니다. 유전자 발견의 수단으로 사용할 수도 있습니다. 현자의 사용은 1995 년 발명 이후 꾸준히 성장했으며 유전자 발현 프로파일은 다양한 조직 및 유기체에서 생성되었습니다. SAGE 기술에 대한 간략한 개요는 다음과 같습니다. 메신저 RNA는 실험 조직에서 수확되며 각 메시지의 폴리에틴 꼬리가 바이오틴이라는 방식으로 이중 가닥 cDNA로 전환됩니다. 이 cDNA는 제한 효소 Nlaiii와 함께 소화되어 3'- 대부분의 Nlaiii 소화 제품을 캡처 한 바이오틴 라벨을 사용합니다. BSMFI 제한 사이트 어댑터 가이 단편에 연결됩니다. BSMFI는 인식 사이트에서 약 14 개의 기본 쌍의 위치에서 DNA를 절단합니다. 이로 인해 원래 조직에있는 mRNA 전 사체 각각의 정의 된 위치에서 짧은 표현 된 서열 태그 (EST)가 생성됩니다. 이들 단편은 함께 결합되어 표준 플라스미드 벡터에 복제되고 서열 된 EST의 CONCATEMER를 형성한다. 각 클론은 최대 60 mRNA 성적 증명서를위한 태그를 식별하는 태그를 포함 할 수 있습니다. 각 태그의 상대적인 위치가 알려져 있고 NLAIII 현장이 제외되면 NLAIII 부위가 제외되면 10 개의 염기 시퀀스로 구성되므로 MRNA 전 사체를 고유하게 식별합니다.

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