 | SSA.DNA 서열에서 최대 우도 계통 발생을 유추하는 프로그램 |
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SSA. 순위 및 요약
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SSA. 설명
SSA는 DNA 시퀀스로부터 최대 우도 계통 발생을 유추하기위한 프로그램으로 개발되었습니다. 두 가지 버전의 프로그램을 사용할 수 있습니다. 분자리 시계와이 가정을하지 않는 사람을 가정합니다. ML 트리의 나무의 공간을 검색하는 방법은 시뮬레이션 된 어닐링 형 알고리즘을 기반으로하며 상기 참조에서 설명된다. 이 프로그램은 뉴클레 타이드 대체 및 관련 서브 모델의 Felsenstein의 F84 모델을 구현합니다. 프로그램은 ML 트리 및 분기 길이를 추정하고 선택적으로 횡단 / 횡단율 비율을 추정 할 수 있습니다. 종료시, 프로그램은 검색 중 가장 높은 가능성의 K 나무를 반환합니다. 여기서 K는 사용자가 설정할 수 있습니다.
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