트리 파인더 분자 서열에서 계통 발생 나무를 계산합니다.
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트리 파인더 순위 및 요약

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트리 파인더 설명

TreeFinder 응용 프로그램은 분자 서열에서 계통 발생 나무를 계산합니다. 이 프로그램은 시퀀스 진화의 다양한 모델에서 최대한의 가능성을 통해 큰 나무를 유발합니다. 그것은 뉴클레오티드와 아미노산 데이터를 모두 허용하고 이질성을 고려하여 요금을 취득합니다. 별도의 모델은 사용자 정의 데이터 파티션, 별도의 속도, 별도의 가장자리 길이, 별도의 문자 작성에 대해 가정 할 수 있습니다. 모든 매개 변수는 데이터에서 추정 할 수 있습니다. 트리 검색은 사용자가 제공 한 토폴로지 제약 조건에 의해 안내 될 수 있으며 나무를 시작합니다. 시퀀스 진화의 적절한 모델을 제안하는 모델 제안자가 있습니다. 유추 된 나무의 신뢰도는 파라 메트릭 및 비 파라 메트릭 부트 스트랩, 다양한 페어리트 테스트 (ELW, BP, KH, SH, WSH, AU)에 의해 평가 될 수 있습니다. 나무와 시퀀스 데이터를 조작하고 기본 주파수를 시각화하고 합의 및 거리 트리를 계산하는 도구가 있습니다. 모든 수치 결과에 대한 신뢰 제한 및 기타 통계를 얻을 수 있습니다. 이 프로그램은 비율 부드럽게 발산 시간을 추정 할 수 있습니다. 그래픽 사용자 인터페이스는 TreeFinder를 매우 직관적으로 사용합니다. 데이터 파일 및 재구성 매개 변수를 대화식으로 선택하여 결과가 화면에 표시됩니다. TreeFinder는 다양한 기능을 제공하는 기능 및 시스템 독립적 인 프로그래밍 언어 TL에서 프로그래밍 할 수 있으며 연구원이 문제 해결 응용 프로그램을 만들 수 있습니다. 소프트웨어의 일부는 TL로 작성되며 사용자가 수정할 수 있습니다. TreeFinder의 언어 TL은 생물학적 데이터를 처리하는 수많은 전문 도구를 갖춘 범용 프로그래밍 언어입니다. TreeFinder 프로그램의 프로그래밍 인터페이스 역할을합니다. 이 설명서는 TL에 대한 개요를 제공합니다. 다른 프로그래밍 언어와 다른 TL을 사용하는 것은 다양한 프로그래밍 스타일을 지원한다는 것입니다. 언제든지 프로그래머는 주어진 상황에서 가장 강력한 프로그래밍 스타일을 선택할 수 있습니다.

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