조개

이 도구로 시퀀스를 분류합니다.
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조개 순위 및 요약

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  • Rating:
  • 특허:
  • Freeware
  • 게시자 이름:
  • The Regents of the University of California
  • 운영체제:
  • Windows All
  • 파일 크기:
  • 20.4 MB

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조개 설명

CLAMS는 메타 테고니엄 시퀀스를위한 서열 구성 기반 분류자를 제공하도록 특별히 고안된 편리한 응용 프로그램입니다. CLAMS는 시퀀스 구성을 기반으로 각 시퀀스의 서명을 캡처하여 작동합니다. 각 시퀀스는 기본 마르코프 체인 속성이있는 DE BRUIJN 그래프에서 산책으로 모델링됩니다. CLAMS는 기본 마크프 체인의 고정 매개 변수와 기본 DE BRUIJN 그래프의 구조적 매개 변수를 캡처 하여이 서명을 형성합니다. 실제로, 각 서열에 대해, 그러한 서명은 계산되고 훈련 세트에 대해 계산 된 유사한 서명과 일치한다. 정규화 된 거리 차단 승리를 자격이있는 가장 좋은 일치입니다. 가장 좋은 일치 가이 컷오프 자격이되지 않는 경우, 시퀀스는 비공식이 남아 있습니다.


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