¿ø¼þÀÌ ¼øÀ§ ¹× ¿ä¾à
- °Ô½ÃÀÚ À̸§:
- M. Wayne Davis
¿ø¼þÀÌ Å±×
¿ø¼þÀÌ ¼³¸í
APE´Â ÀÛ°í »ç¿ëÇϱ⠽¬¿î Çö󽺹̵å ÆíÁý±â·Î °³¹ßµÇ¾ú½À´Ï´Ù. ÁÖ¿ä Ư¡: ÆíÁý â¿¡¼ Á¦ÇÑ »çÀÌÆ®¸¦ °Á¶ Ç¥½Ã È¿¼Ò ºÎÀ§ÀÇ ´ï / DCM Â÷´ÜÀ» Á¤È®ÇÏ°Ô ¹Ý¿µÇÑ´Ù ´Â »çÀü Á¤ÀÇµÇ°í »ç¿ëÀÚ Á¤ÀÇ ±â´É ¶óÀ̺귯¸®¸¦ »ç¿ëÇÏ¿© ÅؽºÆ®¸¦ °Á¶ Ç¥½ÃÇÕ´Ï´Ù ´Â ½Ç½Ã°£ ¿¡¼ ¼±ÅÃµÈ DNAÀÇ ¹ø¿ª, TM, % GC, ORF¸¦ µµ½ÃÇÑ´Ù. DNA ½ºÆ®¶óÀÌ´õ, FASTA, GENBANK ¹× EMBL ÆÄÀÏ ¸¦ ÀнÀ´Ï´Ù. ´Â DNA ½ºÆ®¶óÀÌ´õ ȣȯ ¶Ç´Â GenBank ÆÄÀÏ Çü½ÄÀ¸·Î ÆÄÀÏÀ» ÀúÀåÇÕ´Ï´Ù ´Â GenBank ¹× Embl ÆÄÀÏÀÇ ±â´É ÁÖ¼®À» »ç¿ëÇÏ¿© ±×·¡ÇÈ ¸ÊÀ» °Á¶ Ç¥½ÃÇÏ°í ±×¸³´Ï´Ù ´Â NCBI ¶Ç´Â Wormbase ¿¡¼ ¼±ÅÃµÈ ¼ø¼¸¦ Á÷Á¢ ºÐ»çÇÑ´Ù. ÅؽºÆ® ¸ÊÀº ÅؽºÆ® ±â¹Ý ±×·¡ÇÈÀ¸·Î DNA ½ÃÄö½º, ¹ø¿ª ¹× ±â´ÉÀ» º¸¿©ÁÝ´Ï´Ù ´Â ±×·¡ÇÈ Á¦ÇÑ ¸Ê ¼±Çü ¶Ç´Â ¿øÇüÀ» ³ªÅ¸³À´Ï´Ù. ÇÏÀÌÆÛ ¸µÅ©°¡ÀÖ´Â ±×·¡ÇÈ ¹× ÅؽºÆ® ±â´ÉÀ» µÎ ¹ø Ŭ¸¯ÇÕ´Ï´Ù ±×·¡ÇÈÀ» ĸ½¶È µÈ Æ÷½ºÆ® ½ºÅ©¸³Æ® ¶Ç´Â È®Àå °¡´ÉÇÑ º¤ÅÍ ±×·¡ÇÈÀ¸·Î ÀúÀåÇÕ´Ï´Ù ±×·¡ÇÈÀ» Windows ¸ÞŸ ÆÄÀÏ·Î º¹»ç ¹× ÀúÀå °¡»ó Á¦ÇÑ ´ÙÀÌÁ¦½ºÆ® ¹Ì¸® Á¤ÀÇµÇ°í »ç¿ëÀÚ Á¤ÀÇ DNA Ladders ¸¦ ±×¸³´Ï´Ù. ´Â ¸¦ µÎ ¹ø Ŭ¸¯ÇÏ¿© ÅؽºÆ®¿¡ ´ë¿ªÀ» ¿¬°áÇÕ´Ï´Ù. ´Â ABI ½ÃÄö½Ì ÃßÀû ÆÄÀÏÀ» ÀнÀ´Ï´Ù ABI Æ®·¹À̽ºÀÇ ¼¿Àº Á¤·Ä ÇÏÀÌÆÛ ¸µÅ©°¡ TE Æ®·¹À̽º·Î µÇµ¹¾Æ °¡¸é¼ ±âÁØ ¼¿¿¡ Á÷Á¢ Á¤·Ä µÉ ¼öÀÖ´Ù. ¸ðµç ¿·ÁÀÖ´Â Windows ¿¡¼ ¿©·¯ ±âÁØ (Union / Vertersection- ÁÖÆļö, »çÀÌÆ® À¯Çü)°ú ÀÏÄ¡ÇÏ´Â »çÀÌÆ® ¼±Åà ´Ù¸¥ ½ÃÄö½ºº¸´Ù ´õ ÀÚÁÖ ÀÚÁÖ Àý´Ü µÈ »çÀÌÆ®¸¦ ¼±ÅÃÇÕ´Ï´Ù (SNIP-SNP ŽÁö ¶Ç´Â Áø´Ü ´ÙÀÌÁ¦½ºÆ® ¿ë) ´Â ¿¹¸¦ µé¾î ¿Ö°îÇϱâ À§ÇØ »ç¿ëÀÚ Á¤ÀÇ È¿¼Ò ±×·ìÀ» Á¤ÀÇÇß´Ù. ÇöÀç Àç°í ÀÖÀ½ È¿¼Ò. »ç¿ëÀÚ´Â À̸§°ú ÀÎ½Ä »çÀÌÆ®·Î »õ·Î¿î È¿¼Ò¸¦ Á¤ÀÇ ÇÒ ¼ö ÀÖ½À´Ï´Ù Rebase ¿¡¼ »ç¿ëÇÒ ¼öÀÖ´Â DNA ½ºÆ®¶óÀÌ´õ Çü½Ä ÆÄÀÏ (°£´ÜÇÑ È¿¼Ò, »çÀÌÆ® ¸ñ·Ï)À» °¡Á®¿É´Ï´Ù. ´ëºÎºÐÀÇ ºÐ¼® âÀº ´ÙÀ½À» Æ÷ÇÔÇÏ¿© ÇØ´ç ½ÃÄö½º¿¡ ÇÏÀÌÆÛ ¸µÅ©µË´Ï´Ù. ±×·¡ÇÈÁöµµ ÅؽºÆ® ¸Ê °¡»ó ´ÙÀÌÁ¦½ºÆ® Á¤·Ä (ABI ½ÃÄö½º Æ÷ÇÔ) Á¶¿ëÇÑ »çÀÌÆ® ¹ø¿ª ÇÁ¶óÀÌ¸Ó Ã£±â ´Â »ç¿ëÀÚ Á¤ÀÇ ±â´É Á¤ÀÇ ¶óÀ̺귯¸®¸¦ »ç¿ëÇÕ´Ï´Ù. ÀÌ´Â ´ÙÀ½À» Çã¿ëÇÕ´Ï´Ù. ½ÃÄö½ºÀÇ ºü¸¥ ÁÖ¼® ±ÍÇÏ (¶Ç´Â ±âŸ)°¡ ½ÃÄö½º ¿¡ ÇÏÀ̺긮µå È µÈ »ç¿ë °¡´ÉÇÑ ¸ðµç ÇÁ¶óÀ̸ÓÀÇ ºü¸¥ °Ë»ö ¹× °Á¶ Ç¥½Ã ¿©·¯ °¡Áö ¹æ¹ýÀ¸·Î ÁÖ¼® ó¸®µÇ°í ½Ã°¢ÈµÇ´Â ¼ø¼¸¦ ½Å¼ÓÇÏ°í È¿À²ÀûÀ¸·Î ÇÁ¶óÀÌ¸Ó ¹ÙÀεù »çÀÌÆ®¿Í ¸ðµç Èï¹Ì·Î¿î ½ÃÄö½º ±â´ÉÀ» º¸¿©ÁÖ´Â ±×·¡ÇÈÁöµµ ´Â ¼±Åà »ç¾ç ÀÎ DNA Á¤·Ä ·Î ½ÃÄö½º¸¦ ¹ø¿ªÇÕ´Ï´Ù. »ç¿ëÀÚ ±âÁØ ÀÏÄ¡ (±æÀÌ, TM, % GC, ÀÚ±â / ´Ù¸¥ º¸¿Ï¼º) ÀáÀçÀû ÀÎ ÇÁ¶óÀÌ¸Ó Ã£±â ´Â µÎ °³ÀÇ DNA ¼¿ (¶Ç´Â ¼¿ ¹× ABI Æ®·¹À̽ºÀÇ ÀÓÀÇÀÇ Á¶ÇÕ)À» Á¤·ÄÇÏ¿© ¿ø·¡ÀÇ ½ÃÄö½º ¿¡ ÇÏÀÌÆÛ ¸µÅ©¸¦ Á¤·ÄÇÑ´Ù. ´Â ¹ø¿ª ÀûÀ¸·Î Á¶¿ëÇÑ Á¦ÇÑ »çÀÌÆ®¸¦ ã´Â´Ù ±×·¡ÇÈ ORFÁöµµ ±×¸®±â
¿ø¼þÀÌ °ü·Ã ¼ÒÇÁÆ®¿þ¾î