스누커스 게놈 하이브리드 화 데이터 뷰어.
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스누커스 설명

SnoopCGH는 비교 게놈 하이브리드 화 (CGH) 데이터를 시각화하고 탐색하는 데 도움이되는 Java Desktop 프로그램입니다. 이 소프트웨어를 사용하면 여러 데이터 집합을 동시에 대화식으로 분석 할 수 있습니다. 입력은 하나 이상의 비교 또는 샘플에 해당하는 일련의 로그 강도 값을 포함하는 탭, 공백 또는 쉼표로 구분 된 형식을 기반으로합니다. SnoopCGH는 마우스와 대화식으로 탐색 할 수있는 무제한 줌 (두 축 모두)으로 CGH 플롯을 제공합니다. 적층 및 결합 될 수있는 다중 레이어의 사용은 데이터의 시각화를 용이하게합니다. CGH 비율을 필터링하거나 관심있는 영역에서 통계적 분석을 수행하기 위해 여러 계층을 플롯에 적용 할 수 있습니다. 분석 방법이 구현되어 체결 된 구조 변화 (SV)의 신속한 시각화 및 해부를 가능하게합니다. 특히, 데이터는 HAAR 웨이브 렛을 기반으로 한 알고리즘을 사용하여 평활화되며 잠재적 인 SV의 섬은 SW-Array를 사용하여 추정됩니다. 우리는 견고성을 증가시키기 전에 추상을 제거하고, 순열을 사용하여 통계적 중요성과 통계적 중요성의 견고성을 추정합니다. 추정 된 SVS의 정량화는 관심 지역의 순위를 매기는 능력을 초래합니다. 다른 SV 탐지 알고리즘은 미래에 통합 될 수 있습니다. SnoopCGH의 강력한 기능은 유전자 이름 및 게놈 기능에 대한 정보가 포함 된 게놈 브라우저에서 다운로드 가능한 주석 파일과 인터페이스 할 수있는 능력입니다. 사용자는 플롯의 발에 주석의 시각적 표현을 가지며,이를 클릭하거나 텍스트 검색을 통해 자세한 텍스트 정보에 쉽게 액세스 할 수 있습니다. 주요 게놈 브라우저에 대한 직접적인 링크가 통합됩니다.

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