| ºñ½º³ëÇÁ Bisulfite-seq / nome-seq snps ¹× cytosine methylation ¹ß½ÅÀÚ |
Áö±Ý ´Ù¿î·Îµå |
ºñ½º³ëÇÁ ¼øÀ§ ¹× ¿ä¾à
- °Ô½ÃÀÚ À̸§:
- USC Epigenome Center
ºñ½º³ëÇÁ ű×
ºñ½º³ëÇÁ ¼³¸í
BISSNP´Â °Ô³ð ºÐ¼® ÅøŶÀ» ±â¹ÝÀ¸·ÎÇÏ´Â À¯¿ëÇÑ µµ±¸·Î Ưº°È÷ °³¹ßµÇ¾ú½À´Ï´Ù. BISSNP´Â À¯ÀüÀÚÇü ¹× ¸ÞÆ¿È ¼öÁØÀ» µ¿½Ã¿¡ °áÁ¤ÇϱâÀ§ÇÑ »óÀÌÇÑ ½ÃÅä½Å ÄÁÅؽºÆ®ÀÇ ¼öµ¿À¸·Î ÁöÁ¤µÇ°Å³ª ÀÚµ¿À¸·Î ÃßÁ¤ µÈ ¸ÞÆ¿È È®·üÀ» °®´Â º£ÀÌÁö¾È Ãß·ÐÀ» »ç¿ëÇÑ´Ù. ÀÌ ¼ÒÇÁÆ®¿þ¾î´Â ´ÜÀÏ ¿£µå ¹× Æä¾î¸µ µÈ ¿£µå Àб⿡ »ç¿ëÇÒ ¼ö ÀÖ½À´Ï´Ù. BISSNP´Â Java ÇÁ·Î±×·¡¹Ö ¾ð¾î·Î °³¹ßµÇ¾ú½À´Ï´Ù. ÁÖ¿ä Ư¡: ¼Ò¼ö µÈ ¼¼Æ÷ »çÀÎ ¸Æ¶ôÀÇ ¸Þƿȸ¦ ¿ä¾àÇÏ°í ¿ä¾à ÇÑ (CpG, ChH, ChG, Gch et.al.); Á¤È®ÇÑ º¯ÀÌü °ËÃâ. Bisulfite Sequencing¿¡¼ ±âº» Ç°Áú º¸°ü ¹× Àεµ ¼Û·á¸¦ °¡´ÉÇÏ°ÔÇÕ´Ï´Ù. ´Â ´ÙÁß Ãâ·Â Çü½Ä, »ó¼¼ÇÑ VCF ÆÄÀÏ, CPG ÀÏȸÇüÀÌ ¸ð³ë - ´ëÇü ¸ÞÆ¿È ºÐ¼®À» À§ÇØ ÆÄÀÏÀ» ÀнÀ´Ï´Ù. UCSC °Ô³ð ºê¶ó¿ìÀú ¹× IGV ºê¶ó¿ìÀú¿¡¼ ½Ã°¢È¸¦À§ÇÑ °£´ÜÇÑ º£µå ±×·¡ÇÁ, °¡¹ß ¹× ħ´ë Çü½Ä.
ºñ½º³ëÇÁ °ü·Ã ¼ÒÇÁÆ®¿þ¾î