가족

이 도구로 DNA 시퀀스를 분석합니다.
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가족 순위 및 요약

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  • Philipp M. Schluter
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가족 설명

DNA 지문 인쇄 (AFLP, RAPD, ISSRS 등) 연구는 본질적으로 기술과 관련된 소음이든 득점 등의 소음이든 또는 득점 등의 불확실성을 제공합니다. 부재 / 존재 (0/1)를 사용하여 데이터를 획득 할 수 있습니다. 즉, 결석 및 사정 (보수적 인 것보다는 보수적 인 경우 아마 결석)에 확신 할 수없는 데이터 포인트 파티션을 시도 할 것입니다. 또는 불확실성을 허용 할 수 있습니다 : (0 / λ / 1). 이를 통해 나중에 데이터를 두 번째로 살펴 보고이 모호하거나 누락 된 데이터가 분석에있을 수있는 영향을 묻습니다. FAMD는 조금 쉽고, 사용하기 쉽도록 특별히 고안된 응용 프로그램입니다. 구체적으로 누락 된 (또는 모호한) 데이터를 해결하는 경우 FAMD는 다음을 구현합니다. · 최소 / 최대 / 평균 (DIS) 유사성 계산은 누락 된 데이터가 분석에 영향을 줄 수있는 정도의 추정을 허용합니다. · Jaccard, Dice, SMC 유사점, Neili 및 Euclidean 거리 · 거리 매트릭스의 출력 · 누락 된 데이터 샘플링 · 부트 스트랩으로 Shannon의 색인의 추정. · upgma, 뉴저지, 엄격하고 대다수 규칙 합의 나무 · R 지원의 추정 · 비트 맵 및 메타 파일 지원이있는 PCOA (주 좌표 분석) 및 3D 뷰어 · 모든 시행 (DIS) 유사성 조치를위한 AMOVA · Nexus, Arlequin 프로젝트, 힌디어, 히코리 (Nexus Alleles Block), Genepop, NTSSPC, 구조, 힌두 렉스와 같은 여러 가지 형식으로 데이터의 수출. · Bayesian의 인구 널 대립 유전자 주파수 및 인구 간 거리 계산.


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