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RNA 2 차 구조와 RNA 모티프 찾기를 정렬합니다 RSMATCH는 RNA 구조를 비교하기 위해 가벼운 접근법을 제공하도록 설계된 무료이며 사용하기 쉬운 패키지로 기능 구조 요소를 밝혀냅니다. RNA 구조 비교를위한 다른 도구와 비교할 때, RSMATCH는 빠르며 두 개의 주어진 구조의 크기에 따라 2 차 시간이 필요합니다. RSMATCH는 두 개의 채점 체계, 즉 독립적이고 위치 의존적 인 구성표를 사용합니다. 위치 독립적 인 계획은 두 개의 점수 매트릭스를 수반합니다. 하나는 단일 가닥 영역과 이중 가닥 영역에 대해 하나입니다. 이 득점 체계는 쌍으로 현명한 비교 및 데이터베이스 검색에서 사용됩니다. 프로파일이라고도하는 위치 종속 체계는 개별 구조 위치를 점수화하고 여러 구조 정렬 및 반복 데이터베이스 검색 기능에 의해 사용됩니다. RSMATCH는 후자가 대부분의 경우 더 유용하더라도 전역 및 로컬 정렬 옵션을 제공합니다. 또한 rSmatch는 input.note : SOEM 예제로 패턴 기반 구조를 여기에서 사용할 수 있습니다. 요구 사항 : · 자바
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