Compucell 3D. 모델링 환경 및 PDE 솔버
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Compucell 3D. 순위 및 요약

Compucell 3D. 태그

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Compucell 3D. 설명

모델링 환경 및 PDE 솔버 Compucell 3D는 셀룰러 행동을 공부하는 데 사용되는 오픈 소스 모델링 환경 및 PDE 솔버입니다. Compucell은 기존 소프트웨어를 재현하는 코드를 개발할 수있는 리소스에 대한 리소스를 처리 할 필요없이 연구자 (생물학 자 및 물리학 자)를 모델링하는 데 도움이되도록 개발되었습니다. 코드는 Python 래퍼가있는 C ++에 빌드됩니다. 사용자는 XML 파일에서 모델 매개 변수를 쉽게 정의하고 Compucell 플레이어 인 Gui와 함께 시뮬레이션을 실행할 수 있습니다. Compucell 3D는 시뮬레이션의 실시간 시각화뿐만 아니라 복잡한 모델에 대한 쉬운 인터페이스를 제공합니다. 요구 사항 : · 파이썬 2.5 이상 이 릴리스에서는 새로운 기능 : · 신규, 재 설계된 Compucell 플레이어가 스티어링 능력을 갖춘 능력을 갖춘 · 이전에 저장 한 시뮬레이션 결과 재생, VTK를 사용하여 더 나은 그래픽 렌더링 · 다른 많은 개선 사항. 새로운 유형의 사용자를 추가 할 수있는 능력 도입 · 새 플레이어에서 렌더링 할 수있는 정의되고 사용자 제어 필드. · MacOS의 경우 우리는 David Larson이 작성한 작지만 유용한 응용 프로그램을 배포합니다. · 사용자가 실험 사진을 픽셀 화하고 PIF로 변환 할 수 있습니다. · 초기화 파일. 사용자는 실험 이미지를 "페인트"하고 셀을 할당합니다. · 페인트 영역에 대한 유형. · 세포 내 네트워크 모델을 해결하는 실험적, 외부 모듈 추가 · SBML로 작성되었습니다. 이 기능은 여전히 베타 버전에 있지만 통합하는 것 같습니다. · CC3D가 매우 훌륭합니다. 우리는이 점에서 사용자를 우리의 진보로 업데이트 할 것입니다. · 자동 모드에서 시뮬레이션을 실행하는 기능 (플레이어 사용하지 않음). 결과는 · VTK 형식으로 저장되며 Compucell 중 하나를 사용하여 사후 처리 할 수 있습니다. · 플레이어 또는 사용자 정의 작성 스크립트. · 신축성이있는 가소성으로 바뀌 었습니다. 모든 시뮬레이션은 CC3D 버전을 위해 작성되었습니다 · 현재 전류 및 가소성 플러그인을 사용하여 업데이트하고 변경해야합니다. · "가소성"이라는 단어는 "탄력성"에 이 명명 규칙은 더 나은 것과 관련이 있습니다 · 이러한 플러그인이 구현하는 것. · 재구성 된 소스 코드 디렉토리 구조 · 사용자가 사용자 정의 용어를 지정할 수있는 새로운 반응 확산 솔버 · 다시 컴파일이 필요하지 않습니다 · 탄력 플러그인, ContactLocalProduct 플러그인을위한 업데이트 된 기능, · 수많은 버그 수정

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