 | AssociationViewer.일반적인 컨텍스트에서 SNP를 쉽게 볼 수 있습니다. |
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AssociationViewer. 순위 및 요약
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AssociationViewer. 설명
일반적인 맥락에서 SNP를 쉽게 볼 수 있습니다 AssociationViewer는 유전 적 컨텍스트에서 SNP를 디스플레이하는 데 사용되는 자유롭고 오픈 소스 Java 응용 프로그램입니다. 유전자 또는 LD 플롯과 같은 데이터 (예 : 유전자 또는 LD 플롯)가 플라이의 다양한 공용 데이터 소스에서 다운로드되어 캐시에 로컬로 저장됩니다. 사용자 정의 데이터는 보충 트랙으로 추가 할 수 있습니다. 다음은 "AssociationViewer"의 몇 가지 주요 기능이 있습니다. · 일반적인 게놈 브라우저와 유사한 유전 적 맥락에서 SNP 및 P-VACES를 표시합니다. · Ensembl / Biomart에서 보충 정보를 자동으로 다운로드하십시오 · HAPMAP LD 플롯 (현재 CEU 인구에서 오는) 디스플레이 · 나중에 다시로드 될 수있는 보고서 작성 (하나 또는 여러 관심 영역으로 만들어졌습니다). · 디스플레이를 다양한 데이터 형식으로 인쇄 및 내보내기 · 침대와 같은 외부 데이터 파일 가져 오기 또는 보충 트랙으로 흔들리지 · SNP의 기본 파일과 해당 P 값을 제외하고는 데이터 또는 데이터 소스의 로컬 복사본을 필요로하지 않습니다. · 사용자는 실시간으로 데이터를 스크롤하고 탐색 할 수 있습니다. · 크기가 작 으면 (AssociationViewer 자체가 500KB 미만, 필수 라이브러리가있는 5MB 미만) · 다운로드 된 데이터는 더 빠른 액세스를 위해 로컬로 캐시에 보관됩니다. · 캐시로 인해 메모리 요구 사항은 합리적이며 시간이 지남에 따라 일정해야합니다 (순간 SNP가 응용 프로그램이 닫히는 순간에로드됩니다) 요구 사항 : · 자바 1.6. · 최소 1024 x 768 화면 해상도 · 일하는 인터넷 연결 · 256MB RAM. 이 릴리스에서는 새로운 기능 : 버그 수정 : · 2816294 : 외부 데이터 소스를 확인할 때 잠재적 인 버그. · 2816154 : 최근 HAPMAP 변경에 관한 버그. 구현 된 기능 : · 2728254 : 시계열에 지원되는 새로운 형식 (XML)은 사양에 대한 AssociationViewer PDF 설명서를 참조하십시오. · 2590069 : 빈 트랙 (선택한 염색체에 데이터 없음)이 표시되지 않습니다. · 2378292 : 새로운 라이브러리 (FreeHep)는 비트 맵 및 벡터 형식 모두에 대한 새로운 내보내기 기능을 제공합니다. · 1969368 : 이전의 새로운 기능과 연결됩니다. 벡터 형식을 사용하여 내보내기 해결을 늘릴 수 있습니다.
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