인트론 마커 파이프 라인 게놈 서열이 제한되지 않은 종의 템플릿으로 EST를 사용하여 EST를 사용하는 인트론 핀딩 프라이머의 설계
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인트론 마커 파이프 라인 순위 및 요약

인트론 마커 파이프 라인 태그

순서 인트론 마커 파이프 라인 표현 된 시퀀스 태그 EST 시퀀스 동부 표준시 intron.

인트론 마커 파이프 라인 설명

유전주의 서열이없는 종의 템플릿으로 EST를 사용하여 EST를 사용하는 인트론 측면 설계 인트론 마커 파이프 라인 (IMP) 파이프 라인은 Flank가 표현 된 시퀀스 태그 (ESTS)에서 인트론 위치를 예측 한 프라이머 설계를위한 자동화 된 도구로 개발되었습니다. 인트론 마커 파이프 라인 (IMP)은 유용한 게놈 서열 데이터가 제공되지 않는 종을 설명하는 것을 목표로합니다. 입력에 필요한 것은 EST 시퀀스를 포함하는 FASTA 파일이며 인트론 예측에 사용되는 게놈 시퀀스가 포함 된 또 다른 FASTA 파일입니다. 이렇게하면 사용자가 최적의 유연성을 허용하여 사용 된 정확한 시퀀스를 제어 할 수 있습니다. 설치 지침 : · 터미널의 TAR -ZXVF 파일 이름을 사용하여 현재 배포 · 포장을 잊어 버린 (자체 포함 폴더를 만듭니다) · reapeatmasker, blat, geneseqer 및 primer3 명령 줄 유틸리티를 설치하고 각각에 대한 실행 파일을 포함하여 하나 (예 : / usr / local / share / applications / primer3 / src / primers_core) · infb의 기본 디렉토리에서 perl install.pl을 실행 · 프롬프트가 표시되면 이미 표시된 경로를 입력하십시오. · 반복자 · Blat. · Geneseqer. · Primer3 명령 줄 유틸리티

인트론 마커 파이프 라인 관련 소프트웨어