바이오 코코아 열기 소스, objective-c 시퀀스 파일 형식 구문 분석 및 쓰기를위한 프레임 워크
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바이오 코코아 설명

오픈 소스, 시퀀스 파일 형식 구문 분석 및 쓰기를위한 objective-c 프레임 워크 BIOCOCOA는 개방형 소스이며 BioInformatics 용 Open Source 및 Objective-C 기반 코코아 프레임 워크입니다. Cocoa는 신속한 응용 프로그램 개발을위한 훌륭한 프레임 워크이므로 혁신적인 생물학적 응용 프로그램을 만드는 데 자주 사용됩니다. BIOCOCOA는 개발 속도를 높이기 위해 분자 생물학 및 바이오 플리폼에 특유한 재사용 가능한 코코아 수업을 제공하기를 원합니다. 현재 BIOCOCOA는 생물 시퀀스의 모델 클래스, 정렬, 시퀀스 조작 및 I / O 용 컨트롤러 클래스를 제공하며 Entrez와 인터페이싱하고 자신의 응용 프로그램에서 시퀀스를 쉽게 표시하고 작업 할 수있는 클래스를 볼 수 있습니다. 이 릴리스에서는 새로운 기능 : · 디스크 기반 접미사 배열을 생성하고 해당 접미어 배열을 사용하여 서열의 최대 공통 접두사를 찾는 새로운 BCSUFFIXARRAY 및 BCMCP 클래스. · 전체 시퀀스를 메모리로 읽지 않고 서열 데이터를 읽지 않으면 서 시퀀스 데이터를 읽을 수있는 새로운 BccacheDequenceFile 및 BccachedFastAfile 클래스. 이것은 전체 게놈과 같은 매우 큰 시퀀스를 사용하는 데 유용합니다. 이후 릴리스는 시퀀스가 메모리에 있거나 디스크에 캐시 된지 여부에 관계없이 일관된 시퀀스 인터페이스를 제공하는 bccacheDequence를 지원합니다. · BCFileFormat을 사용하여 BCSEQUENCEREADER에 파일 형식을 설명 할 수 있습니다. · 문서 업데이트. · GNUTEP에 대한 완전한 포트를 사용하면 모든 BCFOUNDATION 기능을 사용할 수 있어야합니다. · 32 / 64 비트 및 PPC / Intel 프로세서를 지원하는 쿼드 팻 바이너리.

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