견장 단백질을 순서와 3D 구조로 정렬하는 사용자 친화적 인 Java 프로그램
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단백질 맞추다 생물학 단백질을 정렬하십시오 mRNA 시퀀스 단백질 주석

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단백질을 순서와 3D 구조로 정렬하는 사용자 친화적 인 Java 프로그램 스트랩은 수백 개의 단백질의 동시 분석을 지원하고 아미노산 서열, 3D 구조 및 게놈 및 mRNA- 서열, 2 차 구조 및 잔류 주석을 통합하는 크로스 플랫폼 프로그램입니다. 정렬은 MS-WORD에서 수출 및 수정 될 수 있습니다. 또는 다른 텍스트 프로세서가 포함 된 자습서는 스트랩의 사용을 1 시간 만에 가르칩니다. 스크립팅 성과 확장 가능성은 가장 진보 된 사용자조차도 매우 강력한 도구를 묶을 수 있습니다. 다음은 "strap"의 주요 기능이 있습니다. · 시퀀스 정렬 계산 · 위키 계산 : 3D-superpositions (예 : 출력) 및 구조 기반 단백질의 여러 정렬 Pubmed : TM 정렬 또는 CE 또는 Gangsta + 3D 중첩. 조합 된 시퀀스 구조 정렬. · Wiki를 사용하여 3D 시각화 : pymol 또는 wiki : jmol 또는 rasmol 및 vmd. 준비 : Yasara 강조 표시, 위키 : SNPS, Wiki : 엑손 - 인트론 경계 또는 3D로 높은 서열 보존이있는 지역. 3D 객체, 시퀀스 및 정렬 간의 즉각 선택 · 위키 : "폭발 경고"를 포함한 폭발 검색 · 예측 : Wiki : Transmembrane Helices, 위키 : 2 차 구조 및 위키 : 코일 코일 · 아미노산 서열에 대한 뉴클레오타이드 서열의 번역. 뉴클레오타이드 정렬으로서 아미노산 정렬의 출력. · 단백질 파일 형식 : 위키 : Swissprot, Wiki : PDB, 위키 : FASTA, MSF, Biowiki : 스톡홀름, 위키 : Clustalw, 위키 : 넥서스, HSSP 위키 : Genbank, Embl · ATV, Wiki가있는 계통 발생 나무 : Jalview 및 Genebee · 잔류 물과 뉴클레오타이드 주석 Wiki를 강조 표시 : 정규 표현식 (I.E.e.e. 찬성 패턴) Wiki를 사용하여 : 증분 검색 및 Wiki : Wiki의 시퀀스 기능 : DAS 서버 : 시퀀스 유사성이 낮기 때문에 까다로운 시퀀스 정렬 · CE 및 TM 정렬을 사용하여 C- 알파 원자의 3D 중첩 공간 동등한 잔류 물 · Dotplot. · 중간 시퀀스 · 혼합 서열 정렬 및 단백질 구조 정렬 · Wiki : 플러그인은 타사 개발자의 스트랩 확장입니다. 요구 사항 : · 자바 · Objective-C 및 Fortran의 컴파일러

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