codonw. CODONW는 코돈 및 아미노산 사용의 다변량 분석 (대응 분석)을 단순화하도록 고안된 프로그램입니다.
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산 코돈 다 변수 분석 대응 분석 산성 사용 아미노

codonw. 설명

CODONW는 코돈 및 아미노산 사용의 다변량 분석 (대응 분석)을 단순화하기 위해 고안된 프로그램입니다. CODONW는 코돈 및 아미노산 사용의 다변량 분석 (대응 분석)을 단순화하기 위해 고안된 프로그램입니다. 또한 코돈 사용의 표준 인덱스를 계산합니다. 메뉴와 명령 줄 인터페이스가 모두 있습니다. Codonw 프로젝트는 John Peden의 Paul Sharp, Genetics의 부서, 노팅엄 대학교에서 작성되었습니다. John은 인간 유전학에서 일하고 있으며 현재 옥스포드 대학의 WTCHG에서 Procardis 데이터베이스 관리자로 고용되어 있습니다. · "Codonw"의 주요 기능이 있습니다. 독립 · 제한 없음 1. 시퀀스 수 2. 시퀀스 길이 · 코돈 사용 인덱스를 계산합니다. CAI : 코돈 적응 Index2. FOP : 최적 코드의 빈도 3. NC : codons4의 유효 수. CBI : 코돈 바이어스 지수 · 아미노산 indices1을 계산합니다. 그레이비 스코어 2. 방향족 성 · 대응 분석을 계산합니다. 코돈 사용량 2. RSCU (상대 동의어 코돈 사용) 3. 아미노산 사용 · 대응 분석 1. 코돈 / 아미노산을 포함 / 제외 할 수있다. 트렌드 3의 상세한 보고서를 생성 할 수 있습니다. 최적의 코돈을 자동으로 식별하려고 시도합니다 .4. 추가 데이터 세트를 추가 할 수 있도록 허용 할 수 있습니다. 5 개의 트렌드 수를 기록합니다. · 유전자 파라미터 1을 계산합니다. 유전자 길이 2. GC, GC3S 및 코돈 위치 특정 G + C 3. 디 뉴클레오타이드 조성물 (3 개의 코돈 프레임 모두에서) 4. 아미노산 사용량 5. 상대 아미노산 사용 6. 코돈 사용량 7. 상대 동의어 코돈 사용 · 개념적으로 단백질로의 서열을 번역 할 수 있습니다 · 재 포맷 서열 데이터 · 인간 또는 기계 판독 가능 출력 · 유전자 (독서 프레임을 보존하는 동안)를 계산할 수 있습니다. 전체 코돈 Usage2. GC Content3. Dinucleotide 조성 · 코돈, 아미노산 또는 RSCU 사용법의 테이블을 생성 · 유전자 코드를 배우는 데 도움이 될 수도 있습니다. ·

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