Staden Package. Staden Package는 완전히 개발 된 DNA 시퀀스 어셈블리, 편집 및 분석 도구 세트입니다.
지금 다운로드

Staden Package. 순위 및 요약

Staden Package. 태그

데이터 분석기 순서 집회 DNA. DNA 시퀀스 서열 조립품

Staden Package. 설명

Staden 패키지는 완전히 개발 된 DNA 시퀀스 어셈블리, 편집 및 분석 도구 세트입니다. Staden Package는 UNIX, Linux, MacOSX 및 MS Windows 용 DNA 시퀀스 어셈블리 (GAP4), 편집 및 분석 도구 (스핀)의 완전히 개발 된 세트입니다. GAP4 앞에는 IT 점수가 찾는 방식에 대한 점수가 어떻게 조인하는지에 관한 관련성이있는 사소한 조인점이있었습니다. JOIN EDITOR의 조인 편집자의 정렬 단추의 내부 조인 및이 기능성. GAP4에 대한 결과는 IO_LIB (모든 I / O의 모든 I / O의 다양한 추적 파일 형식에 대한 Thelibrary)의 다양한 변경 사항입니다. 이제 새로운 해시 exp 프로그램이 추가로 실험 파일이 함께 바뀌고 인덱싱 할 수 있습니다. 실험 파일 목록은 GAP4에 STIL을 제공하지만 EXP_PATH 환경 범위가 올바르게 설정되어 있음을 제공하면 CONCATENED Experiment FileArchive에서 개별 개별을 가져올 수 있습니다. BeMade.454 SFF 아카이브가 이제 더 잘 지원되는 사용자 인터페이스를 향상시킵니다. DefSult 454 IndiceNow는 해시 _SFF 프로그램을 사용하여 Analternative Indexing Strategy (경우에 따라 더 빠르게 발생할 수 있음) .GAP4 및 TREV도 기본 호출 당 1 샘플 스캔 (x4 채널)을 추적하기위한 또 다른 추적 디스플레이 스타일을 가지고 있습니다. 이 경우 Canalso는베이스 당 1 대신 4 개의 신뢰 값을 끌어냅니다. 이러한 능력은 더 많은 솔레사스 흔적을 더 잘 통합 할 때 더 많은 솔렉시터를 더 잘 통합 할 수 있습니다. 물론 버그 수정 및 사소한 조정의 일반적인 혼합을 섞습니다. 자세한 내용은 (SourceForge 사이트를 통해) The Serfull 변경 로그를 참조하십시오. 다른 주목할만한 ChangeCAP4 · 다양한 SNP 후보자 개선. "상관 관계 오프셋"은 이제 조절 가능합니다 (그룹이 자동 병합을 위해 그룹이 고려되기 전에 필요한 평균 상관 점수가 제어됩니다). SNP 기본 호출은 이제 100 % 신원이 필요하지 않고 합의를 생성하여 작동합니다. 이제 Refs 메모가 포함 된 시퀀스를 건너 뜁니다. 병합은 그룹 수가 소정의 양 (nb : 일반적으로 이상적이 아님) 이하일 때까지 강제로 강제로 섞을 수 있습니다. · 셔플 패드는 이제 정렬을위한 "밴드 크기"매개 변수가 있습니다. 또한 다양한 장소에서 수정 된 버그도 있습니다. · 이전 편집기 shuffle 명령이 스트립 패드로 대체되었습니다. 이제 패드의 전체 열 만 제거하고 모든 패드 이동을 수행하지 않습니다. · 가입 편집기 정렬 버튼은 반복되는 데이터에서 긴 정렬을 취급하고 "역동적 프로그래밍의 실제 사용을 위해 너무 오랫동안 사용하기가 너무 오랫동안 사용하기가 너무 길지 않기를 바랍니다." 사례. 이제 "정렬"버튼의쪽에 ""버튼이 있습니다. 이러한 앵커의 한쪽 끝은 현재 중첩 위치에 대한 정렬의 한쪽 끝을 왼쪽 또는 오른쪽으로 만 정렬합니다. 이는 여러 반복 요소로 구성된 데이터를 정렬 할 때 유용한 특정 위치에서 정렬을 강제로 강제로 강제로 묶습니다. · 내부 조인 찾기에서 발견 된 정렬은 이제 ID의 비율 이외에 정렬 점수를 고려합니다. 이것은 100 % ID에서 100bp 중첩이 더 이상 99 % 정체성에서 2kB 중첩보다 더 우수한 중첩으로 간주되지 않는다는 것을 의미합니다. · Contig 탐색 창에는 이전 및 다음 경기를위한 페이지가 위와 페이지 다운 키 바인딩이 있습니다. 또한 Contig 편집기 "자동 디스플레이 트레이스"기능을 사용하여 적절한 영역에 트레이스를 자동으로 표시 할 수 있습니다. · "보기 목록"창이 이제 Save button.io_lib · 새 프로그램 : 해시 _Exp, hash_sff, append_sff, presure_fastq · RawData (정의 된 경우)를 기본 설정으로 사용할 TRACE_PATH 및 EXP_PATH 환경 변수가 추가되었습니다. · 이제 WGET 대신 libcurl을 사용하여 훨씬 빠른 웹 기반 추적 페칭을 사용합니다.

Staden Package. 관련 소프트웨어