Ssummo. rRNA 시퀀스의로드에 분류학 정보를 할당하는 프로그램
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파이썬 시퀀스 택시

Ssummo. 설명

SSUMMO는 HMMER를 사용하여 TAXA에 시퀀스를 할당하기 위해 반복적으로 설계된 기능 라이브러리입니다. 결과는 해당 커뮤니티에서 종 / 속 배포를 보여주는 주석이 달린 나무입니다. 소스 코드에 포함 된 프로그램에는 다음을 포함하는 도구가 포함됩니다. ; - Simpson, Shannon 및 기타 방법을 사용하여 생물 다양성 분석, ratchabundance.py - DataSets를 쉽게 교차시키는 쉽게 비교할 수있는 클래디 그램으로 결과를 시각화합니다. HTML 표현 - DICT_TO_HTML.PY .- 플롯 낙하산 곡선 및 해당 생물 다양성 인덱스 계산 Python 소스 코드는 여기에 Google 코드에서 제공됩니다. HMMS의 미리 작성된 계층 적 데이터베이스는 물론 최적화 된 SQL 분류 데이터베이스 (각 분류군의 계급에 사용되는 데 사용됨)에서 다운로드 할 수 있습니다 : - http://bioltfws1.york.ac.uk/ssummo/download/for 설치 정보, README를 참조하십시오. 사용 정보는 Wiki (위)가 있으며 예비 사용자 설명서가 SVN Trunk.Product의 홈페이지에 추가되었습니다.

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