ModelEstimator. ModelEstimator는 정렬 된 시퀀스의 입력에서 아미노산 대체율을 추정합니다.
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아미노산 아미노 견적 산산을 추정한다 정렬 된 시퀀스 ModelEstimator.

ModelEstimator. 설명

ModelEstimator는 정렬 된 시퀀스의 입력에서 아미노산 대체율을 추정합니다. ModelEstimator는 정렬 된 시퀀스의 입력에서 아미노산 대체율을 추정합니다. 이 방법은 앞으로 나오는 종이에 설명되어 있습니다. 사용 : 사용법 : ModelEstimator infile은 FASTA, Stockholm 또는 Phylip 형식으로되어야합니다. 출력은 octave / matlab format.options : -indels가 갭 열을 제거하는 속도 매트릭스 및 잔여 분포 벡터입니다. 갭은 '-'로 표시됩니다. -threshold 연속 반복이 이상으로 변경되지 않을 때 정지하십시오. 기본값은 0.001입니다. -PAML PAML과 함께 사용하기위한 출력 모델. - FASTA와 함께 사용하기 위해 -Fasta 출력 대체 매트릭스 (PAM250). -v verbose. stderr에 대한 진행 정보를 표시합니다. -OCTAVE 실행을 위해 옥타브 바이너리를 가리 킵니다. 기본적으로 '옥타브'. -d 디버그 옵션. 옥타브 명령을 stdout으로 출력하십시오. -version 버전 정보 표시. -u, -h이 도움말 텍스트.

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