CSB. 계산 구조 생물학 도구 상자
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CSB. 태그

파이썬 라이브러리 파이썬 뼈대 생물학

CSB. 설명

CSB는 Python 라이브러리 및 응용 프로그램 프레임 워크로 계산 구조 생물학 분야의 문제를 해결하는 데 사용할 수 있습니다. 이 분야에서 일하는 생물 정보학 자, 소프트웨어 엔지니어 또는 연구원이있는 경우 여기에서 유용한 것을 찾을 수 있습니다. 우리의 패키지는 몇 가지 주요 구성 요소로 구성됩니다. 1. 핵심 클래스 라이브러리 - 객체 지향, 세분화 된 디자인 및 깨끗한 인터페이스에 중점을 둡니다 .2. 응용 프로그램 프레임 워크 - 콘솔 응용 프로그램 ( "프로토콜")은 실행 파일을 구축하기 위해 핵심 라이브러리에서 객체를 소비합니다. 테스트 프레임 워크 - 라이브러리가 실제로 작동하는지 확인하십시오. PatybilityIn 짧은 : Python 2.6 또는 Linux에서 Python 2.7에서 개발 중입니다. 그러나 호환성은 디자인 목표이며 패키지는 버전 2.6 이후로 현대적인 Python 인터프리터에서 모든 플랫폼에서 작동합니다 (예, 파이썬 3 지원이 포함 된 경우). 개발 환경과 다른 플랫폼 / 통역사에 대한 문제를 발견하면 알려주십시오. 우리는 친절하게 사과 드리며 문제를 해결하고 문제가 해결 될 수 있는지 확인하기 위해 회귀 테스트 케이스를 작성하여 인터프리터 호환 가능합니까? 그렇다면 CSB가 의존하는 몇 가지 사소한 패키지를 설치하십시오. 1. numpy - 필수 (numpy.scipy.org) 2. Scipy - 필수 (scipy.org) 3. matplotlib 및 wxpython - 선택 사항은 csb.io.plots4를 사용하려는 경우에만 필요합니다. Unittest2 - Python 2.65를 사용하는 경우에만 필요합니다. argparse - Python 2.6을 사용하는 경우 Windows에 CSB를 설치하고있는 경우 필요할 수 있습니다. NUMPY, SCIPY 및 MATPLOTLIB는 바이너리 MSI / EXE 패키지에서 설치할 수 있으며, 나머지는 PYPI에서 설치할 수 있습니다. 데비안 유사 Linux 배포판에서는 패키지 관리자를 사용합니다. apt-get install : python-numpy, python-scipy, python-matplotlib.finally 중 하나 인 위치 csb 자체 : python setup.py installcsb is just just 다음 위치에 설치됩니다. Python -C "Import CSB, OS; Print (os.path.abspath (os.path.abspath (os.path.jawspath (__ , '경로 __ ,'.. ')))"이 경로를 호출하자 $ lib . CSB 테스트 스위트는 소스 코드를 수정 한 경우 또는 설치 Works.All CSB 테스트가 csb.test.console로 실행되는지 확인하려는 경우 유용 할 수 있습니다. 콘솔을 실행하는 일반적인 방법은 Python $ lib / csb / test / app.py "csb.test.cases. *"또는 그냥 : Python $ lib / csb / test / app.pyfor 도움말 : Python $ lib / CSB / TEST / APP.PY -H 업무 단위 테스트 지침을 포함하여 테스트 프레임 워크에 대한 자세한 내용은 API 문서, 패키지 "CSB.TEST"를 참조하십시오. 제품의 홈페이지

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