Bio :: 색인 :: Swissprot. BIO :: index :: SwissPRot은 인덱싱 (다중) SwissProt .dat 파일 (즉, 플랫 파일 스위스 프로 포맷)을위한 Perl 인터페이스입니다.
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Bio :: 색인 :: Swissprot. 순위 및 요약

Bio :: 색인 :: Swissprot. 태그

Perl 모듈 상호 작용 펄 Perl 인터페이스 스위스 프로 포맷

Bio :: 색인 :: Swissprot. 설명

BIO :: Index :: SwissPRot은 인덱싱 (다중) SwissProt .dat 파일 (즉, 플랫 파일 스위스 프로 포맷)을위한 Perl 인터페이스입니다. BIO :: Index :: SwissPROT은 인덱싱 (다중) SwissProt .dat 파일 (즉, 플랫 파일 스위스 프로 포맷)을위한 Perl 인터페이스입니다. Swissprot 파일에 대한 인덱스를 만들기위한 코드 완료 Bio :: Index :: SwissPROT; 엄격한 사용; 내 $ index_file_name = Shift; 내 $ inx = bio :: index :: swissprot-> new ( '- filename'=> $ index_file_name, '-write_flag'=> 'write'); $ inx-> make_index (@argv); # GCG 형식의 인덱스 #에있는 여러 시퀀스를 인쇄합니다. BIO :: Index :: Swissprot; 바이오 :: Seqio; 엄격한 사용; MY $ OUT = BIO :: SEQIO-> NEW ( '- FORMAT'=> 'gcg', '-fh'=> * stdout); 내 $ index_file_name = Shift; MY $ INX = BIO :: index :: Swissprot-> new ( '- filename'=> $ index_file_name); 내 $ ID (@ARGV) {MY $ SEQ = $ INX-> FETCH ($ ID); # 반환 된 바이오 :: SEQ 개체 $ out-> write_seq ($ seq); } # # 또는 ($ ID, $ ACC); 내 $ seq1 = $ inx-> get_seq_by_id ($ ID); $ seq2 = $ inx-> get_seq_by_acc ($ acc); bio :: index :: abstract.pm에서 dbm 파일을 관리하는 함수를 상속하고 SwissProt 파일을 인덱싱하고 해당 시퀀스를 검색하는 기본 funtionally를 제공합니다. James Gilbert의 Fasta System에서 무겁게 재갈. 참고 : 최상의 결과를 위해 구성에서 Strict'.details를 사용하고 추가 예제 코드는 biodatabases.pod 파일에서 사용할 수 있습니다. 요구 사항 : · Perl.

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