Bio :: 도구 :: 추측 qformat.

파일의 시퀀스 형식, 문자열 또는 파일 핸들을 통해 결정을 결정하기위한 모듈
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Bio :: 도구 :: 추측 qformat. 순위 및 요약

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Bio :: 도구 :: 추측 qformat. 태그


Bio :: 도구 :: 추측 qformat. 설명

파일, 문자열 또는 파일 핸들을 통해 파일의 시퀀스 형식을 결정하기위한 모듈 Bio :: Tools :: GuesseqFormat 파일, 문자열 또는 fileHandle.synopsis #을 통해 파일 이름, 문자열의 시퀀스 형식을 결정하기위한 Perl 모듈입니다. 파일 이름 : My $ Guesser = BIO :: Tools :: GuessSeqFormat-> New (-file => $ Filename); 내 $ FORMAT = $ 촬영자 -> 추측; # 이미 열려있는 파일 핸들의 형식을 추측하려면 : My $ Guader = BIO :: Tools :: GuessSeqFormat-> New (-fh => $ FileHandle); 내 $ FORMAT = $ 촬영자 -> 추측; # 파일 핸들이 탐색 할 수있는 경우 (stdin이 아닌 경우) # 원래 위치로 돌아 왔습니다. # 텍스트의 하나 또는 여러 줄의 형식을 추측합니다 (# 포함 된 뉴 라인 포함) : my $ geader = bio :: Tools :: GuessSeqFormat-> new (-text => $ linionoftext); 내 $ FORMAT = $ 촬영자 -> 추측; # BIO :: Tools :: GuessSeqFormat 개체를 만들고 # Filename, FileHandle 또는 행을 구문 분석으로 설정합니다. My $ Guader = BIO :: Tools :: GuessSeqFormat-> new (); $ 촬영자 -> 파일 ($ filename); $ 촬영자 -> FH ($ FileHandle); $ 촬영자 -> 텍스트 ($ linionoftext); #이 주어진 한 번에 추측 할 수 있습니다. 파일 이름 : MY $ format = bio :: tools :: guessseqformat-> new (-file => $ filename) -> 추측; bio :: 도구 :: 추측은 형식을 추측하려고 시도합니다 ( "스위스", "pir", 파일의 시퀀스 또는 MSA, 스칼라 또는 파일 핸들을 통해 시퀀스 또는 MSA의 "BIO :: Tools :: GuessSeqFormat 객체의 추측 () 메소드가 데이터를 검사합니다. 하나의 형식 만 할당 할 수있는 행을 찾습니다. 결정적인 추측이 없으면 Undef가 반환됩니다. BIO :: Tools :: GuessSeqFormat 객체가 탐색 할 수있는 파일 핸들이 주어지면 추측 () 메서드에서 돌아 오는 원래 위치로 복원됩니다. 요구 사항 : · Perl.


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