BIO :: DB :: GFF :: 기능 BIO :: DB :: GFF :: 기능은 기능 유형으로 식별되는 상대 세그먼트입니다.
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BIO :: DB :: GFF :: 기능 순위 및 요약

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Perl 모듈 펄 라이브러리 펄 기준 치수 상대 세그먼트

BIO :: DB :: GFF :: 기능 설명

BIO :: DB :: GFF :: 기능은 기능 유형으로 식별되는 상대 세그먼트입니다. BIO :: DB :: GFF :: 기능은 기능 Type로 식별되는 상대 세그먼트입니다 .Bio::DB::GFF:Feature GFF 데이터베이스의 단일 주석에 해당하는 시퀀스의 스트레치입니다. BIO :: DB :: GFF :: RELSEMMENT에서 상속 되므로이 수업 및 조상의 상대적 주소 지정에 대한 모든 지원이 있습니다. 또한 Bio :: SeqFeaturei에서 상속이므로 익숙한 시작 (), stop (), primary_tag () 및 location () 메서드가 있습니다 (Bio :: locationi도 필요합니다.) .BIO :: DB :: GFF : : 기능은 주석의 유형, 그룹 및 기타 GFF 속성을 검색하는 새로운 메소드를 추가합니다. 주석 유형은 bio :: db :: gff :: typeName 객체, method () 및 source ()라는 두 가지 메소드가있는 간단한 클래스로 표시됩니다. 이들은 GFF 파일의 메소드 및 소스 필드에 해당합니다 .Annotation Groups 주석을 인간이 읽을 수있는 이름을 주석을 제공하고 하위 기능의 고차원 그룹을 특징으로 제공하는 이중 목적을 제공합니다. 이 모듈이 반환 한 그룹은 바이오 :: DB :: GFF :: FEARNAME CLASS.BIO::DB::GFF::FEATURE가 BIO :: SEQFEATUREI의 추상적 인 메소드를 상속하고 구현할 수있게 해줍니다. 기타 BioPerl 모듈 .Generally, 바이오 :: DB :: GFF :: 기능 개체를 직접 작성하거나 조작하지는 않지만 BIO :: DB :: GFF :: RELSEMENT-> FEATURS () 메소드가 리턴하는 값을 사용합니다. 중요 () vs end () relative 어드레싱 (기본값)을 사용하는 세그먼트에서 기능을 파생 한 경우 기능이 참조 시퀀스의 반대 가닥에있는 경우 시작 ()이 끝납니다. ...에 이는 Bio :: Seqi 준수를 해제하지만 참조 지점을 변경할 때 시작 () 및 End () 스왑 장소에서 지정된 실제 게놈 위치를 피하기 위해 필요합니다.이 문제를 피하려면 가져 오기 전에 $ segment-> 절대 (1)을 호출하십시오. 그것의 특징. 이것은 모든 것을 절대 좌표로 강제로합니다. 예 : My $ segment = $ DB-> 세그먼트 ( 'chromosome_i'); $ segment-> 절대 (1); @Features = $ segment-> 기능 ( '성적 표시); 요구 사항 : · Perl.

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