BIO :: DB :: DAS :: CHADO.

차라 데이터베이스에 대한 DAS 스타일 액세스
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BIO :: DB :: DAS :: CHADO. 순위 및 요약

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  • Rating:
  • 특허:
  • Perl Artistic License
  • 게시자 이름:
  • Scott Cain
  • 게시자 웹사이트:
  • http://search.cpan.org/~scain/

BIO :: DB :: DAS :: CHADO. 태그


BIO :: DB :: DAS :: CHADO. 설명

Chado 데이터베이스에 대한 DAS 스타일의 액세스 CHADO는 GMOD 데이터베이스 스키마이며 CHADO는 특정 인스턴스입니다. 이 패키지는 아직 다소 움직이는 대상 이므로이 패키지는 앞으로 몇 개월 동안 계속해서 습득하기 위해 몇 가지 업데이트가 필요합니다 .Bio::DB:DAS :::chado는 차라 데이터베이스에 대한 DAS 스타일 액세스를 제공하는 Perl 모듈입니다. .SNOPSIS # 기능 데이터베이스 열기 $ db = bio :: db :: das :: Chado-> new (-dsn => dbi : pg : dbname = gadfly; host = lajolla '-user =>'Jimbo ') - 패스 => 'supersecret',); @segments = $ DB-> 세그먼트 (-name => '2L', -start => 1, -end => 1000000); # 세그먼트는 BIO :: DAS :: SEGMENTI - 호환 객체 # 기능 목록을 가져옵니다. @Features = $ DB-> 기능 (-type => ); # $ DB-> 기능 (-TYPE => [ 'type', 'type2', type3 ', -callback => sub {...})을 통해 # 콜백을 호출합니다. # 모든 기능 유형 가져 오기 @Types = $ DB-> 유형; # 카운트 유형 % types = $ DB-> 유형 (- enumerate => 1); @ feature = $ DB-> get_feature_by_name ($ class => $ name); @ feature = $ DB-> get_feature_by_target ($ target_name); @ feature = $ DB-> get_feature_by_attribute ($ att1 => $ value1, $ att2 => $ value2); $ feature = $ db-> get_feature_by_id ($ ID); $ error = $ db-> 오류; 요구 사항 : · Perl.


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