 | 중앙 Proteomics 시설 파이프 라인MS / MS Proteomic 데이터 분석 파이프 라인 |
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중앙 Proteomics 시설 파이프 라인 순위 및 요약
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중앙 Proteomics 시설 파이프 라인 태그
중앙 Proteomics 시설 파이프 라인 설명
MS / MS Proteomic 데이터 분석을위한 파이프 라인 중앙 Proteomics 설비 파이프 라인 (CPFP)은 학술 단백질 핵심 시설의 요구를 목표로하는 MS / MS Proteomic 데이터의 분석을위한 파이프 라인입니다. 파이프 라인은 다중 검색 엔진과 TPP (Trans Proteomic Pipeline) 도구를 사용하여 LC-MS / MS Proteomic Datasets의 쉽고 강력한 검색, 유효성 검사 및 정량을 제공합니다. CPFP는 현재 마스코트 (Matrix Science), 탠덤 (Native)으로 검색을 지원합니다. 및 K-SCORE) 및 OMSSA. 단일 양식은 매개 변수 파일을 만들고 수정 사양의 차이를 조정할 필요없이 세 가지 프로그램을 모두 제출할 수 있습니다. Regengine 클러스터의 작업을 사용하여 처리를 수행하여 처리가 쉽게 데이터 볼륨으로 확장 될 수 있습니다. 분석되면 증가합니다. 이탈로그와 동위 원소는 파이프 라인에서 (silac / heaml dimethyl / icat)가 수행 될 수 있습니다. Pipeline.CPFP는 옥스포드 대학교에서 적극적으로 개발 된 옥스포드 대학에서 작성되었으며 옥스포드의 핵심 시설의 요구를 지원하기 위해 매일 사용되었습니다. 여기에서는 여기에서는 CDDL 라이센스로 오픈 소스 소프트웨어로 출시됩니다.
중앙 Proteomics 시설 파이프 라인 관련 소프트웨어
