시드 워싱 자세 가장자리 라벨이있는 조직에서 세포의 이미지 스택을 상호 작용하는 그래픽 파이썬 프로그램
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SeedwaterSegnEer는 가장자리 라벨 (일명, 흰색 윤곽선)으로 조직에서 세포의 이미지 스택을 대화식으로 세그리밍하는 그래픽 파이썬 도구입니다. 상호 작용은 씨앗 편집에 기반을두고 유역 알고리즘에 의해 차례로 확장됩니다. SWS와 다른 도구 간의 주요 차이점은 어려운 셀의 경계를 조정하는 데 도움이되는 셀 당 둘 이상의 씨를 배치 할 수 있다는 것입니다 .SWS는 WXPYTHON, MATPLOTLIB, NUMPY, SCIPY 및 MAHOTAS의 맨 위에 구축됩니다. 이는 마토스 프로젝트 덕분에 번개가 빠른 유역 알고리즘을 사용하고 실시간 업데이트를 허용합니다. 그것은 단순한 (어수선한 경우) UI를 가지고 있으며 완전히 대화식이며, 1 레벨 실행 취소를 포함합니다. SWS에 대한 간행물은 이러한 모든 세부 사항을 제공합니다. /cyto.a.22034/ABStractSource 코드는 4 개의 저장소와 Pypi로 미러링됩니다 : - Github : http://github.com/davidmashburn/seedwatersegmenter/- bitbucket : http://bitbucket.org/davidmashburn/seedwatersegner - gitorious : http://gitorious.org/seedwatersegneder- Google 코드 : http://code.google.com/p/seedwater/- pypi : http://pypi.python.org/pypi/seedwatersegnerThe Google 코드 페이지에는 일부 바이너리가 있습니다. 32 비트 Windows 또는 64 비트 Linux에서 작동해야하지만 이들은 이제 오래된 릴리스 (http://codewater/.com/p/seedwater/)를 릴리스합니다 (http://codewater/.com/p/seedwater/). 지금은 "easy_install"메소드를 사용하십시오. 자세한 내용은 파이썬 설치 지침 20xx.txt를 참조하십시오. Seedwater Segmenter V xx manual.txtinstiling 및 wrininginstilling이 마침내 쉽습니다! 실제로, 이제 "Easy_install을 사용할 수 있습니다. Seedwatersmenter "빠른 지침 : Windows / Mac : 설치 Python 배포 http://www.enthought.com/products/edudownload.phpubuntu/debian : sudo-setuptools python-wxtools python-wxtools python-numpy python-scipy python- matplotlib python-imaging python-xlrd python-xlwtin cmd 창 또는 터미널 (mac / linux), 실행 : easy_install mahotas cmpgen ellipsefitter filenamesort giftiffloader imageContor seedwatersegnerDetaired 명령어 : 최신 버전이 호출됩니다. "Python 설치 지침 2012.txt"https://github.com/davidmashburn/seedwatersmentment/blob/master/python 설치 지침 8 월 2012.txtProduct의 홈페이지

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