 | 바이오 폰생물 정보학을위한 Perl 확장. |
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생물 정보학을위한 Perl 확장. BioPerl 프로젝트는 생물 정보학 응용 프로그램을위한 Perl 스크립트의 개발을 용이하게하는 Perl 모듈 모음입니다. 따라서 많은 상용 패키지와 무료 웹 기반 인터페이스 (예 : Entrez, SRS). 다른 한편으로는 BioPerl은 시퀀스를 위해 Perl 스크립트를 작성하는 것을 용이하게하는 재사용 가능한 Perl 모듈을 제공하는 의미에서 프로그램을 사용할 준비가되어 있지 않습니다. BLAST, CLUSTALW, TCOFFEE, Genscan, Estscan 및 HMMER를 포함한 다양한 분자 생물학 프로그램의 다양한 데이터 형식 및 실행 범위를 사용하여 데이터베이스 액세스, 데이터베이스 액세스. 결과적으로 BioPerl은 웹 기반 시스템으로 일반적으로 어렵거나 불가능한 방식으로 대량의 시퀀스 데이터를 분석 할 수있는 스크립트를 개발할 수있게 해줍니다. BioPerl을 활용하기 위해 사용자는 Perl 프로그래밍 언어에 대한 기본적인 이해가 필요합니다. Perl 참조, 모듈, 객체 및 메소드를 사용하는 방법. 이러한 개념이 익숙하지 않은 경우 사용자는 Perl의 다양한 입문 또는 중간 서적 중 하나를 참조합니다. 우리는 S. Holzmer의 Perl Core Language, Coriolis Technology Press를 좋아했습니다. 이 튜토리얼은 Perl 언어에 거의 또는 전혀없는 경험이없는 사람들에게 Perl의 기본을 가르치는 것이 아닙니다. 반면에 객체 지향 Perl 모듈을 작성하는 방법과 같은 Perl에 대한 고급 지식은 BioPerl.BioPerl을 사용하는 것은 아직 활성 개발중인 오픈 소스 소프트웨어입니다. 오픈 소스 소프트웨어의 장점은 잘 알려져 있습니다. 소프트웨어 라이센스 수수료로부터 소스 코드 및 면제를 자유롭게 조사하고 수정할 수있는 능력이 포함됩니다. 오픈 소스 소프트웨어는 일반적으로 많은 수의 자원 봉사자 프로그래머가 개발 한 결과, 결과 코드는 종종 명확하게 조직되지 않고 사용자 인터페이스가 성숙한 상업 제품에서와 같이 표준화되었습니다. 또한 활동적인 개발중인 프로젝트에서 문서는 새로운 기능 개발을 유지할 수 없습니다. 결과적으로 적극적으로 개발을위한 학습 곡선을 사용하면 오픈 소스 소스 소프트웨어가 때로는 가파른 것입니다. 요구 사항 : · Perl. 이 릴리스에서는 새로운 기능 : · 1.6 시리즈의 첫 번째 핵심 릴리스이며 5 년간의 개발 방출 후 첫 번째 안정적인 릴리스입니다.
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