바이오 :: alignio :: MSF.

BIO :: AlignIO :: MSF는 MSF 시퀀스 입력 / 출력 스트림이있는 Perl 모듈입니다.
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바이오 :: alignio :: MSF. 순위 및 요약

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  • Peter Schattner
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  • http://search.cpan.org/~birney/bioperl-1.4/Bio/Tools/BPlite/HSP.pm

바이오 :: alignio :: MSF. 태그


바이오 :: alignio :: MSF. 설명

BIO :: alignio :: MSF는 MSF 시퀀스 입력 / 출력 스트림이있는 Perl 모듈입니다. BIO :: MINGEIO :: MSF는 MSF 시퀀스 입력 / 출력 스트림이있는 PERL 모듈입니다.이 모듈을 직접 사용하지 마십시오. BIO :: alignio 클래스를 통해 사용하십시오.이 개체는 MSF 플랫 파일 데이터베이스와 함께 BIO :: Align :: Aligni 객체를 변환 할 수 있습니다. 나머지 문서의 나머지 문서는 각 객체 메소드에 대해 자세히 설명합니다. 내부 메소드는 일반적으로 _next_alntitle 앞에 선행됩니다. next_alnusage : $ aln = $ stream-> next_aln () 함수 : 스트림의 다음 정렬을 반환합니다. * ALL * MSF를 읽으려면 정렬 영역에서 모든 공백 문자를 읽습니다. 이상한 격차가있는 MSFS (예 : ~~~)는 $ al-> map_chars ( '~', '-')를 사용하여 맵핑합니다. l objectargs : nonewrite_alntitle : write_alnusage : $ stream- > write_aln (@aln) 함수 : $ aln 객체를 MSF 형식의 스트림에 씁니다. 정렬의 첫 번째 sequence.returns : 1에 대해 1의 첫 번째 sequence.returns에 의해 결정됩니다. errorgs for 0 객체 요구 사항 : · Perl.


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