바이오 :: Affymetrix :: CDF. BIO :: Affymetrix :: CDF는 Affymetrix CDF 파일을 구문 분석하는 Perl 모듈입니다.
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Perl 모듈 분석 Parse Affymetrix CDF. 파일을 구문 분석 Affymetrix.

바이오 :: Affymetrix :: CDF. 설명

BIO :: Affymetrix :: CDF는 Affymetrix CDF 파일을 구문 분석하는 Perl 모듈입니다. BIO :: Affymetrix :: CDF는 Affymetrix CDF 파일을 구문 분석하는 Perl 모듈입니다. SyNopsisUse Bio :: Affymetrix :: CDF; # CDF FileMy $ CDF = 새 BIO :: Affymetrix :: CDF ({ "probemode"=> 0) }; $ cdf-> parse_from_file ( "foo.cdf"); #이 칩 TypePrint $ CDF-> rows ()에 대한 재미있는 사실을 찾습니다. ",". $ cdf-> cols (). "n"; $ CDF-> 버전 (). "n"; #이 칩 TypeForeach의 모든 프로브 셋 이름을 인쇄합니다. TypeForeach My $ i (키 % {$ CHP-> 프로브}) {인쇄 $ CHP-> 프로브넷 -> {$ i } -> name (). "n"; } Affymetrix Microarray 시스템은 다양한 형식으로 파일을 생성합니다. 이것이 당신에게 아무런 의미가 없다면,이 모듈은 아마도 당신을위한 것이 아닙니다 :). 이 모듈은 CDF 파일을 구문 분석합니다. 이 모듈을 사용하십시오. Affymetrix GeneChip의 설계에 대해 알아 보려면이 패키지의 모듈 중 하나의 모듈 중 하나에 대한 개체가 필요합니다. Bio :: Affymetrix 모듈은 완전히 메모리에 파일을 파싱합니다. 따라서 이러한 객체를 보유 할 수있는 충분한 메모리가 필요합니다. 일부 응용 프로그램의 경우 스트림으로 구문 분석 할 수 있습니다. 이러한 모듈에 대한 소스 가이 모듈에 대한 소스 가이 모듈을 쉽게 할 수있는 충분한 단서를 제공 할 수 있습니다. 이 모듈은 프로브 정보도 저장되면 (약 150MB)의 메모리가 많이 필요합니다. 프로브 레벨 정보가 생략되면 메모리 사용량이 너무 쉽지 않습니다 (약 15MB). can.control progeMode => 1 또는 progemode => 0을 설정 하여이 모듈을 사용하여 CDF 파일을 작성할 수도 있습니다 (write_to_filehandle 메소드 사용). 중요한주의 사항에 대한 호환성을 참조하십시오. 요구 사항 : · Perl.

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