바이오 :: 제한 :: 효소 바이오 :: 제한 사항 :: 효소는 단일 제한 endonuclease (특정 위치에서 DNA를 자르십시오).
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Bio :: Restriction :: 효소는 단일 제한 endonuclease (특정 위치에서 DNA를 자르십시오). Bio :: Restriction :: Enzyme는 단일 제한 Endonuclease (특정 위치에서 DNA를 자르십시오) .Snopsis # 단일 제한 효소를 설정하십시오. 여기에는 # Rebase 파일에서 일반적으로 구문 분석 된 효소에 대한 # 정보가 많이 포함되어 있으므로 다시 읽을 수 있습니다. Bio :: Restriction :: Enzyme; # 컷 시퀀스와 함께 새로운 효소를 정의하십시오. My $ Re = New Bio :: Restriction :: Enzyme (-enzyme => 'EcoRi', -sq => 'G ^ Aattc'); # 시퀀스가 정의되면 몇 번의 물건이 계산됩니다. #### 프리 셀렉트 # 효소가 삭감 된 곳을 찾습니다 ... MY $ CA = $ RE-> 컷; # ... 그리고 그것이 반대 가닥에서 자르는 곳은 내 $ OCA = $ RE-> 보완적인 자화; # 잘라 내기 순서 문자열을 다시 가져옵니다. # 사이트는 Caret My $ with_caret = $ Re-> 사이트로 순서를 반환합니다. #RETURES 'G ^ AATTC'; # 그러나 그것은 또한 바이오 :: primarySeq 객체입니다 .... 내 $ n $ nift_caret = $ Re-> 서열; # 'gaattc'를 반환합니다. # ...이므로 String $는 $ RE-> 문자열을 제공하지 않습니다. # 'GAATTC'등록; # 삭감 사이트의 역방향 보수는 무엇입니까 $ rc = $ re-> Revcom; # 'gaattc'를 반환합니다. # 지금 인식 길이. 다음 두 가지 유형이 있습니다. # 인식 _length ()는 Sequence # Cutter () 컷 주파수의 시퀀스 # 커터 ()의 길이 내 $ Recog_Length = $ Re-> 인식 _length; #이 경우에 6 번 반환되지만이 경우 6 번 반환되지만 Ganntc의 # 4와 RGatcy (BSTX2I)에 대해 5 번을 반환합니다! $ RECOG_LENGTH = $ RE-> 커터; # alfindrome - 똑같은 전달과 거꾸로 내 $ pal = $ re-> palindromic; # 이것은 부울 # 시퀀스 무딘입니다 (즉, 오버행 - 앞으로 나아가는 것은 동일합니다. # overhang은 세 가지 값을 가질 수 있습니다 : "5 '", "3'", "둔기", 그리고 Klenow를 사용하는 경우 # 방향이 매우 중요합니다! 내 $ OH = $ RE-> 오버행; # 오버행 시퀀스가 무엇입니까? 내 $ OHSEQ = $ RE-> Overhang_Seq; # 'AATT'를 반환합니다. # 순서가 모호합니다 - 비 gatc 기지가 포함되어 있습니까? MY $ AMBIG = $ RE-> IS_BITOULS; # 이것은 부울 인쇄 "enzymencuts에 대한 것입니다 : $ can", "보완 적 자르기 : $ ocansite : nt $ with_caret orn", "t $ with"; "시퀀스의 반대 : $ rcnrecognition 길이 : $ recog_lengthn", "그것은 Palindromic? $ paln"입니다. 인쇄 "오버행은 $ OH $ OH입니다. ### 당신이 설정할 수있는 것, 부자 인 Rebase 파일에서 얻을 수있는 것 # isoschizomers를 얻거나 설정하십시오 (동일한 # 사이트를 인식하는 효소) $ re-> isoschizomers ( 'pvuii', 'smai'); # 정말로 사실이 아닙니다 :) 인쇄 "Isoschizomers는", "", $ re-> isoschizomers, "n"입니다. # 메틸화 사이트를 얻거나 설정하십시오 $ RE-> methylation_sites (2); # 정말로 진실하지는 않습니다 :) "메틸화", "", 키를 가입 ", 키 % {$ RE-> methylation_sites},"n "; # 또는 소스 미생물 $ Re-> Microbe ( 'coli')를 설정하십시오. "그것은 왔습니다", $ RE-> 미생물 "N"; # IT RE-> 소스 ( "ROB")를 고립 시키거나 설정 한 사람을 설정하거나 설정합니다. # 정말로 사실이 아닙니다 :) $ re-> source, "USN으로 보냈습니다"; # 상업적으로 이용 가능한지 여부를 확인하거나 설정하고 회사 #은 $ RE-> 공급 업체 ( 'NEB')에서 구입할 수 있습니다. # 내가 좋아하는 인쇄 "는 상업적으로 이용 가능합니다 :"; $ RE-> 공급 업체를 인쇄하십시오. "예 아니오"; "인쇄", "가입", $ RE-> 공급 업체, "n"에서 얻을 수 있습니다. # $ RE-> 참조 ( 'Edwards et al. J. Particology')에 대한 참조를 얻거나 설정하십시오. "그것은"$ RE-> 참조 ","N "에 게시되지 않았습니다. # 효소 이름을 얻거나 설정하십시오 $ re-> name ( 'bamhi'); "Ecori의 이름이 실제로", $ re-> name, "n"이 아닙니다.이 모듈은 단일 제한 엔도 뉴 클레아스를 정의합니다. 사용자 정의 제한 효소를 만들기 위해 사용할 수 있으며 Bio :: Restriction :: IO가 뉴 잉글랜드 Biolabs Rebase Collection.Use에 효소를 정의하는 데 사용됩니다. Bio :: Restriction :: Analysed y any to def 그들은 당신의 시퀀스를 자릅니다. 요구 사항 : · Perl.

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